139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1234 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  100 
 
 		 259 aa  507  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  66.8 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  65.74 
 
 		 288 aa  290  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  69.6 
 
 		 265 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  64.09 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  62.8 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  66.95 
 
 		 257 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  49.17 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  47.7 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  47.92 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  48.89 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  42.97 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  50.6 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  40.95 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  40.09 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  42.63 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  45.74 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  37.55 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  38.24 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  39.91 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  40.95 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  41.48 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  49.79 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  45.12 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  43.15 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  37.69 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  36.43 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  40 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  39.67 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  39.34 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  39.47 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  36.4 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  38.03 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  38.03 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  39.35 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  29.88 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  38.06 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  35.32 
 
 		 272 aa  98.6  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  33.8 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  27.47 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  30.77 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  31.2 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  29.91 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  35.83 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  30.24 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  29.22 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  28.91 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  29.2 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.75 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  26.96 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  29.07 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  29.07 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  25.89 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  29.34 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  24.8 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  22.37 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  27.06 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  30.66 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  28.7 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  21.68 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  26.24 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  28.57 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  27.75 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  29.36 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  24.66 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  24.19 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  25.96 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  22.73 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  22.12 
 
 		 233 aa  62  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  25.19 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  25 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  24.28 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  24.44 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  25.63 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  25.6 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  23.98 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  23.67 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  25.2 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  25.2 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  25 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  25.6 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  25.6 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  21.66 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  25.2 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  25.2 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  25.2 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  31.45 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  25.2 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  25.2 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  25.2 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  23.21 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  25.6 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  22.78 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  25.53 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  24.79 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>