45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1069 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  100 
 
 		 212 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  85.85 
 
 		 212 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  84.43 
 
 		 210 aa  324  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  58.65 
 
 		 208 aa  237  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  51.64 
 
 		 213 aa  221  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  50.46 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  56.02 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  38.03 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  37.56 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  37.38 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  38.5 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  37.85 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  35.21 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  39.72 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  34.27 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  34.27 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  33.8 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  39.44 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  34.27 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  29.11 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  35.21 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  33.49 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  39.44 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  36.53 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  39.15 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  34.27 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  32.81 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  31.6 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  31.46 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  38.03 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0046  hypothetical protein  83.33 
 
 		 81 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  32.24 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  32.04 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  32.24 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  31.6 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  33.8 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  31.78 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  31.78 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  31.51 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  31.51 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  36.05 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  25.98 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  30.19 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0047  hypothetical protein  42.86 
 
 		 122 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>