More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4435 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4435  methyltransferase type 11  100 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  88.66 
 
 		 264 aa  448  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  39.06 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  33.88 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.63 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  57.45 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.98 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5195  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 320 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.42 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2525  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 383 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2351  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  51.79 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 274 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  30.94 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.04 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.04 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.15 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0301  hypothetical protein  32.43 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.65 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1753  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 367 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1797  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 374 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  30.63 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.19 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  35.56 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0127  Methyltransferase type 11  41.54 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.59 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  48.15 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3373  methyltransferase type 11  45.76 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.104552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  52.17 
 
 		 347 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  49.02 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  54.17 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.14 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  39.71 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.14 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  42.03 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.33 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.14 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.14 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1567  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.82 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00051335  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 331 aa  48.9  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0275  hypothetical protein  31.08 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 305 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  44.12 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  44.12 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  49.09 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3846  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.73 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000212433  hitchhiker  0.00000000403337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 282 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0261  hypothetical protein  31.08 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  27.94 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 634 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  30.08 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  30.97 
 
 		 377 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  47.92 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 		 1012 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  32.52 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0321  hypothetical protein  32.43 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  55.81 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  30.22 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1499  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.73 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.92 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  39.36 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  51.02 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  30.08 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0255  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4330  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.68 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1352  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.78 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1535  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.78 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000727979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.55 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1605  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.78 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000158565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1462  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.78 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1367  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000820801  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.23 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  30.71 
 
 		 776 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  35.09 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3658  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.70132e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  51.06 
 
 		 1476 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  48.15 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>