More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2681 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  692    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  78.8 
 
 		 356 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  53.49 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  45.95 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  43.75 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  43.33 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  38.4 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  37.25 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  39.42 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  38.82 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  38.94 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  36.97 
 
 		 359 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  39.3 
 
 		 388 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  37.39 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  41.47 
 
 		 356 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  37.78 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  35.51 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  40.12 
 
 		 353 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 360 aa  196  7e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 360 aa  196  7e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  36.21 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  40.92 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  34.84 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  33.93 
 
 		 326 aa  189  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  36.39 
 
 		 352 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  35.86 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  39.43 
 
 		 375 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  33.9 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  36.74 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  31.44 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  36.9 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  35.39 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  35.92 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  37.07 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  35.81 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  28.85 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  38.01 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  36.39 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  33.71 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  36.08 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  34.07 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  34.08 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  32.48 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  34.27 
 
 		 368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 		 361 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  33.24 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  34.55 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  31.98 
 
 		 357 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  32.85 
 
 		 433 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.3 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  36.75 
 
 		 352 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.72 
 
 		 334 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 364 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 		 357 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  34.67 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  35.57 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.75 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  35.54 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 365 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  30.77 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  31.94 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.05 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.58 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  32.39 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.81 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.81 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.81 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 383 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.45 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>