More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5870 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  84.67 
 
 		 260 aa  427  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  58.33 
 
 		 278 aa  284  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  58.33 
 
 		 278 aa  284  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  58.37 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  50.2 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  47.88 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 274 aa  148  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 266 aa  138  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.33 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 249 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 248 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  33.61 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  32.19 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.2 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.11 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.33 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 278 aa  98.6  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 332 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 287 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 376 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 376 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 246 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 244 aa  96.3  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.92 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 245 aa  95.5  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  29.83 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.63 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>