44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4687 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  51.17 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  50.7 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  52.58 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  51.17 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  51.64 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  51.64 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  51.64 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  51.17 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  52.11 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  40.65 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  51.64 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  40.85 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  45.12 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  43.19 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  42.72 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  40.98 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  44.6 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  37.56 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  38.5 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  41.52 
 
 		 226 aa  121  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  35.94 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  35.38 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  35.19 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  37.09 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  36.32 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  34.91 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  37.26 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  32.39 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  31.92 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  37.04 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  34.26 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  34.2 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  38.79 
 
 		 128 aa  72  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  34.73 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  31.98 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  35.51 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  33.49 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  32.41 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  26.94 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  32.41 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1692  hypothetical protein  30.8 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  32.93 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>