45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0542 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  752    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  54.14 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  53.76 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  54.35 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  53.31 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  53.94 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  50.61 
 
 		 372 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  46.43 
 
 		 430 aa  299  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  41.61 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  39.75 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  39.75 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  39.75 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  39.75 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  39.75 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  39.18 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  39.81 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  38.87 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  38.87 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  38.87 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  40.69 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  36.31 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  27.42 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  29.24 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  29.08 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  26.42 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  27.46 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  25.16 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  23.1 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  23.86 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  23.64 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  27.69 
 
 		 308 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  25.13 
 
 		 303 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  22.26 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  22.26 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  22.26 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  19.43 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  17.94 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  26.81 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  29.09 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  26.47 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  24.26 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2642  hypothetical protein  20 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.233765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  23.83 
 
 		 303 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0570111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>