72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2733 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  100 
 
 
138 aa  271  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  58.39 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  58.39 
 
 
137 aa  165  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  39.86 
 
 
138 aa  114  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  34.38 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  32.61 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  33.58 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  40.4 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  35.04 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  31.21 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  39.39 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  29.46 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  29.41 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  28.06 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  31.3 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  34.91 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  28.46 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  40.21 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  35.2 
 
 
271 aa  60.5  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  36.59 
 
 
135 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  36.46 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  35.16 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  37.8 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  30.4 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  39.08 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  31.45 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  30 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  33.03 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  32.54 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  29.55 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  35.63 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  35.2 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  27.27 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  34.04 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  38.27 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  35.19 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  32.06 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  30.83 
 
 
143 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  32.26 
 
 
149 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  34.48 
 
 
295 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  31.53 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  24.81 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  27.64 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  29.01 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  34.62 
 
 
141 aa  48.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2972  hypothetical protein  45 
 
 
46 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  32.94 
 
 
252 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2557  hypothetical protein  47.37 
 
 
55 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  31.67 
 
 
145 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  26.37 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2968  protein of unknown function DUF86  30.17 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2463  hypothetical protein  34.33 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227725  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3141  protein of unknown function DUF86  30.17 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  34.88 
 
 
276 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  28.91 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  28.33 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  30.59 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  38.18 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  31.71 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0324  hypothetical protein  35.9 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  25.56 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1202  protein of unknown function DUF86  37.5 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  28.45 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  25.56 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  26.37 
 
 
138 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0257  protein of unknown function DUF86  43.75 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  21.74 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  32.65 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0759  hypothetical protein  31.33 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.17486  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  29.57 
 
 
292 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>