110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5217 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5217  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 272 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.592377 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5480  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  87.5 
 
 		 272 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  0.229793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  29.03 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3172  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.97 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.85 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  25.3 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.86 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  28.05 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  26.51 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  26.94 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  25.5 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  26.82 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  26.49 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  26.49 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  26.49 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  26.49 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  26.49 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  27 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  24.81 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.25 
 
 		 924 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  25.49 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  26.16 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  26.16 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  24.33 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  25.08 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  28.8 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.49 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  25.33 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  25.08 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  25.08 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  30.91 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.47 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  24.76 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.12 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.86 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  26.69 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  26.63 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  23.67 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  25.32 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1717  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.05 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.37 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  31.88 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  25.83 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  23.05 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  25.16 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  25.32 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  22.15 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  25.6 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  29.07 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  32.54 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  21.5 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  23.63 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000176809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  21.17 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  25.15 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  27.08 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  31.58 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  24 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  32.03 
 
 		 290 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  31.76 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.34 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  23.67 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.6 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.24 
 
 		 298 aa  52  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  32.45 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  23.67 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  23.98 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  23.67 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  29.22 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1232  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.48 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  hitchhiker  0.00338141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.45 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.47 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  29.88 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.63 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  24 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  28 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  30.26 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  29.81 
 
 		 311 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  28.33 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  27.4 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.1 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  34.48 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  28.1 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  28.1 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  25.88 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6358  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.09 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  22.62 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  27.52 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  27.52 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4567  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.73 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.181708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  28 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  28.35 
 
 		 308 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4404  xylose isomerase domain-containing protein  26.88 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.68 
 
 		 359 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  23.68 
 
 		 359 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0747  xylose isomerase domain-containing protein  26.38 
 
 		 250 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4669  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.32 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104946  hitchhiker  0.000000014237 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  28.35 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  33.04 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>