58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3867 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 238 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  91.53 
 
 		 238 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  60.96 
 
 		 246 aa  295  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  61.39 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  50.55 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  43.06 
 
 		 300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  45.16 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  45.74 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  43.56 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  41.55 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  42.03 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  42.94 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  45.09 
 
 		 202 aa  156  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  44.94 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  43.45 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  39.15 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  45.64 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  40.54 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  41.12 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  40.29 
 
 		 283 aa  144  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  41.12 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  41.48 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  40.83 
 
 		 245 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  37.13 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  42.59 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  41.86 
 
 		 195 aa  134  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  36.56 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  39.78 
 
 		 182 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  36.36 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  44.66 
 
 		 176 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  37.14 
 
 		 177 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  31.46 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  29.35 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  29.35 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  30.41 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  29.38 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  28.89 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  27.64 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  28.5 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  30.29 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  28.72 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  27.68 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  32.76 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  25.41 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  30.15 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  29.22 
 
 		 199 aa  46.2  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  30.15 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  26.82 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  30.15 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  26.82 
 
 		 205 aa  45.4  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  24.1 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  28.29 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  26.32 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  24.11 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1458  hypothetical protein  29.32 
 
 		 188 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0910474  normal  0.0228469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  25.65 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>