More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3429 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
307 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.56 
 
 
307 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  44.56 
 
 
307 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.68 
 
 
313 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00226923  hitchhiker  0.00373728 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
291 aa  225  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199241  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
316 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  39.32 
 
 
305 aa  212  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
299 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.01 
 
 
309 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
308 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
308 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
316 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
309 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
309 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
316 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3105  ABC transporter, permease component  41.4 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  40.55 
 
 
287 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
305 aa  195  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
313 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
291 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
294 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  37.92 
 
 
321 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
317 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
316 aa  191  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
292 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
300 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
315 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
316 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000185658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
317 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.37513  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
317 aa  188  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
306 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
293 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
310 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
294 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
317 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.11 
 
 
314 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
306 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
320 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  36.79 
 
 
300 aa  186  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1315  ABC transporter, permease protein  39.07 
 
 
301 aa  186  6e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
318 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0200859  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.04 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.661532 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
294 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
305 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0566553  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
318 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.49 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
306 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
309 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
321 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.49 
 
 
319 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  34.15 
 
 
321 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  37.15 
 
 
294 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
298 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
319 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
318 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
313 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
296 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.74 
 
 
314 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
293 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
314 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0166533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2715  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.77 
 
 
350 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392142  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
311 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
317 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000449996 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  35.07 
 
 
293 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0035  sugar ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 
295 aa  175  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.265224  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.55 
 
 
318 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790586  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
298 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.32 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.980927  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
314 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
305 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.028536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.54 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.899558  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00312349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
316 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  0.915782 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  33.33 
 
 
315 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
319 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.491906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
305 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371496  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
299 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
319 aa  170  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00382098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
314 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00699527 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
309 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  35.25 
 
 
293 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
319 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172357  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
299 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
296 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
317 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>