More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2427 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
322 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.626108 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.32 
 
 
318 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.81 
 
 
318 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.99 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
301 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4988  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.84 
 
 
301 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  33.33 
 
 
318 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
291 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  34.01 
 
 
312 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
314 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
313 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
308 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.45 
 
 
298 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
312 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7824  putative ABC transporter permease protein  35.62 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
300 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
435 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
312 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
309 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
307 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
286 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
313 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
294 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
292 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
427 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  34.6 
 
 
280 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
309 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
293 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  34.73 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
290 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
291 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00180742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
318 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177004  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
289 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205446  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631921  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
310 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
289 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
295 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.06 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
299 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
289 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
289 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 
307 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
307 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
289 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0940  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.18 
 
 
289 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
309 aa  145  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  31.93 
 
 
305 aa  145  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
315 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
280 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
305 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
330 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
316 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
315 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
286 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
310 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
286 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
286 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524108  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 
330 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
283 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
290 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3226  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 
310 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0257  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
291 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.958787  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29440  permease component of ABC-type sugar transporter  33.45 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
309 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
293 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
293 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.140823  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.916696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
315 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270687  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
310 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0634568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
320 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.292649  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
300 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
290 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  32.62 
 
 
293 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.9 
 
 
318 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
309 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 
310 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.95 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3143  sugar ABC transporter  30.77 
 
 
290 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382012  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
289 aa  136  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0888929 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
328 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
320 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>