More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1832 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  71.07 
 
 		 241 aa  359  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  69.14 
 
 		 243 aa  348  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  68.72 
 
 		 243 aa  343  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  67.49 
 
 		 243 aa  342  5e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  64.05 
 
 		 242 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.81 
 
 		 242 aa  325  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  61.83 
 
 		 263 aa  322  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  62.24 
 
 		 246 aa  322  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  63.22 
 
 		 262 aa  321  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  61.57 
 
 		 247 aa  321  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  63.14 
 
 		 245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  61.41 
 
 		 246 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  61.41 
 
 		 258 aa  318  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.81 
 
 		 242 aa  317  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  61.86 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  61.98 
 
 		 258 aa  315  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  63.22 
 
 		 259 aa  315  5e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  61.92 
 
 		 251 aa  314  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.68 
 
 		 251 aa  314  7e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  62.4 
 
 		 251 aa  314  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  60.42 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60.42 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  60.42 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  61.98 
 
 		 270 aa  313  9.999999999999999e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  63.64 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  63.64 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  60.42 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  59.5 
 
 		 253 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  63.22 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  63.64 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  62.81 
 
 		 251 aa  312  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  58.68 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  59.75 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  60.58 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  63.33 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  62.13 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  62.92 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.22 
 
 		 251 aa  311  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  61.25 
 
 		 246 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  63.98 
 
 		 251 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.68 
 
 		 249 aa  311  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.92 
 
 		 259 aa  311  6.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 		 252 aa  311  9e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  58.26 
 
 		 249 aa  310  9e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 242 aa  311  9e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  60.33 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  60.17 
 
 		 262 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  63.33 
 
 		 244 aa  309  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 256 aa  308  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.34 
 
 		 262 aa  308  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  64.46 
 
 		 264 aa  308  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.34 
 
 		 262 aa  308  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  62.81 
 
 		 247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  62.5 
 
 		 248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  61.09 
 
 		 267 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  62.92 
 
 		 265 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  62.4 
 
 		 256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  60.91 
 
 		 252 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  61 
 
 		 247 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  60.17 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.26 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  60.42 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59.5 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59.09 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  58.75 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  61.09 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.4 
 
 		 249 aa  304  7e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  62.5 
 
 		 267 aa  304  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  61.57 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.34 
 
 		 253 aa  304  8.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.68 
 
 		 252 aa  304  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  60.83 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  60.42 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  60.58 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  60.58 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  60 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  58.75 
 
 		 252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  58.75 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  57.55 
 
 		 256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  59.41 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  59.83 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  59.83 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>