More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5596 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5596  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 405 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 		 320 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.14 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 321 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 308 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.35 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.67 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.72 
 
 		 326 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 		 294 aa  67  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  33.33 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  31.98 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  24.79 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  25.88 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.33 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.02 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.36 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.14 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  30 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  25.43 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  24.45 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  28.24 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.48 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 324 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  27.03 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3844  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107726 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  30.38 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  24.67 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  24.44 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  24.44 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 		 439 aa  57  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  26.58 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  26.58 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  29.15 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  23.85 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4953  NADH dehydrogenase  27.35 
 
 		 318 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.03 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  25.09 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.69 
 
 		 329 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  25.52 
 
 		 309 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.7 
 
 		 309 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.574819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 		 321 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  27.44 
 
 		 513 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 		 315 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0332  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  24.85 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171865  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1981  WbjC  30.77 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.31 
 
 		 304 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>