50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4624 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  77.55 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  71.07 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  52.58 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  66.67 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  66.15 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  51.02 
 
 		 274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  50.25 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  49.04 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  49.26 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  47.54 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  42.86 
 
 		 240 aa  89  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2470  hypothetical protein  42.19 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0978713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  40.69 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  39.85 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  39.24 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  43.3 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  42.78 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  36.97 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  30 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  32.08 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  35.37 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  32.1 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  28.31 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  29.5 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  32.97 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  32.52 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  27.93 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  37.93 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  25.15 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  31.51 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  39.41 
 
 		 425 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  38.89 
 
 		 522 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  24.86 
 
 		 294 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  27.22 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  24.86 
 
 		 294 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  33.67 
 
 		 561 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  26.28 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  34.78 
 
 		 568 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  31.62 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4613  hypothetical protein  33.69 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  30.77 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  25.25 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  35.44 
 
 		 254 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  40.38 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  31.87 
 
 		 160 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4757  hypothetical protein  27.65 
 
 		 395 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal  0.483152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  33.75 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  25.56 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  26.13 
 
 		 292 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>