More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3799 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  100 
 
 		 189 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  94.18 
 
 		 189 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  90.48 
 
 		 189 aa  364  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  84.66 
 
 		 189 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  76.19 
 
 		 189 aa  306  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  75.53 
 
 		 188 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  74.47 
 
 		 188 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  72.87 
 
 		 188 aa  293  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  72.87 
 
 		 188 aa  291  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  70.74 
 
 		 188 aa  290  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  287  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  287  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  70.43 
 
 		 186 aa  286  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  71.28 
 
 		 188 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  67.72 
 
 		 189 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  68.25 
 
 		 189 aa  280  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  68.62 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  71.28 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  67.02 
 
 		 216 aa  274  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  68.09 
 
 		 188 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  65.96 
 
 		 188 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  65.43 
 
 		 188 aa  270  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  65.43 
 
 		 188 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  64.89 
 
 		 188 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  68.45 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  50.27 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  49.73 
 
 		 188 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  46.77 
 
 		 187 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  44.92 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  43.01 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  43.32 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  41.4 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  42.47 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  43.01 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  39.36 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  42.47 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  41.71 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  41.4 
 
 		 187 aa  171  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  40.11 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  40.43 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  40.64 
 
 		 213 aa  157  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  39.57 
 
 		 187 aa  157  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  39.57 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  38.71 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  38.71 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  36.96 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  35.83 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  36.96 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  39.13 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  39.67 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  37.97 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  36.17 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  36.61 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  35.91 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  37.16 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  37.16 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  37.22 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  35.33 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  36.9 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  36.41 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  35.64 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  35.64 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  35.64 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  35.11 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  35.11 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  34.57 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  35.11 
 
 		 188 aa  131  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  35.52 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  34.57 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  37.02 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  35.11 
 
 		 188 aa  127  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  37.97 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  35.91 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  38.2 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  34.04 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  35.33 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  33.86 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  35.33 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  37.64 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  36.81 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  35.36 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  31.55 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  35 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  32.24 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>