239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2512 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  94 
 
 
250 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  76.61 
 
 
250 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  76.31 
 
 
250 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.98 
 
 
248 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.33 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.64 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.92 
 
 
246 aa  311  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.61 
 
 
244 aa  270  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.05 
 
 
255 aa  217  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.56 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.15 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.88 
 
 
251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.58 
 
 
245 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.64 
 
 
252 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.18 
 
 
265 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.37 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.24 
 
 
268 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.5 
 
 
258 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.53 
 
 
239 aa  197  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.06 
 
 
262 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.06 
 
 
255 aa  192  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.15 
 
 
238 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.51 
 
 
241 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.9 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.53 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  43.57 
 
 
245 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.45 
 
 
271 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.72 
 
 
254 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  40.65 
 
 
237 aa  178  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.92 
 
 
238 aa  177  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.8 
 
 
276 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.22 
 
 
260 aa  174  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.43 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.16 
 
 
238 aa  169  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.89 
 
 
237 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.24 
 
 
255 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.8 
 
 
243 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.17 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  34.58 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  34.58 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  34.58 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.57 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.91 
 
 
243 aa  125  6e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 
244 aa  125  7e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1675  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.31 
 
 
243 aa  125  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 
240 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 
248 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 
240 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 
251 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
243 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
243 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
243 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 
235 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
243 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1944  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  35.27 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.35633  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0422  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.92 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.644654  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.9 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1860  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.96 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.98 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0805  pyridoxine 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.916602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.44 
 
 
236 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2257  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 
239 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  35.71 
 
 
246 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.02 
 
 
264 aa  118  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.27 
 
 
240 aa  118  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.27 
 
 
240 aa  118  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 
323 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.62 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.62 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.47 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.62 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.71 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.96 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498379  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0646  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.43 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192361  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2455  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.29 
 
 
242 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.19 
 
 
243 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2367  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.29 
 
 
242 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.19 
 
 
243 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0064  pyridoxine 5'-phosphate synthase  30.38 
 
 
235 aa  115  7.999999999999999e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.757519  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1414  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.71 
 
 
249 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.19 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4015  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.03 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.73 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  32.77 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.9 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4053  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.03 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2333  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.73 
 
 
264 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>