79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0638 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0638  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 100 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0606399  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1232  transcriptional regulator protein  86 
 
 		 100 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0056  putative DNA-binding protein  54.74 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000362045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00074  DNA-binding protein  54.17 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0763  Cro/CI family transcriptional regulator-related protein  47.47 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0024  DNA-binding protein  53.68 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.31955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0794  DNA-binding protein  51.52 
 
 		 101 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0156  XRE family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2974  XRE family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3644  DNA-binding protein  50.53 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0164  transcriptional regulator, XRE family  47.96 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.862423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2181  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1818  XRE family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1619  hypothetical protein  47.47 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1811  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4312  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0881286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4706  helix-turn-helix domain-containing protein  45.92 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0850  XRE family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.07607  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2978  transcriptional regulator-like protein  45.65 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3031  transcriptional regulator-like protein  46.74 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1782  transcriptional regulator, XRE family  47 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2627  transcriptional regulator  43.43 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0561718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2894  transcriptional regulator-like protein  46.74 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0125  hypothetical protein  45.65 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7082  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1503  putative DNA-binding protein  46 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.114051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1845  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1497  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.243266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3004  transcriptional regulator-like protein  44.57 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2984  transcriptional regulator-like protein  44.57 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6333  transcriptional regulator-like  44.57 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2370  transcriptional regulator-like  44.57 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1246  transcriptional regulator-like protein  39.8 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2677  helix-turn-helix domain-containing protein  41.84 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1536  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5091  putative DNA-binding protein  43.48 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0262962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4027  putative DNA-binding protein  43.48 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2087  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4058  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326996  normal  0.47831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3986  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4004  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4109  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4174  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4237  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0921  DNA-binding protein  45.95 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.451921  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2546  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3694  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.516749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4182  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1290  hypothetical protein  48.33 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.91858  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4309  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00238443  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1405  hypothetical protein  49.09 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.923263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0471  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1045  putative transcriptional regulator  48 
 
 		 52 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0669957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0860  DNA-binding protein  31.82 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0986  helix-turn-helix DNA-binding domain protein  31.82 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.45543 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0893  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.641947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2809  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3428  XRE family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1413  virulence gene repressor RsaL  40 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1645  putative DNA-binding protein, putative phage gene  38.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0841  hypothetical protein  46.55 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0431891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1852  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00565598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0053  putative DNA-binding protein  47.5 
 
 		 53 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0227133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31960  transcriptional regulator protein  35.82 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0803  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4938  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0484665  hitchhiker  0.0000000184601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3209  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1115  DNA-binding protein, putative  35 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1198  Cro/CI family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3898  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 		 131 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4424  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4246  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4359  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4313  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  40.48 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4268  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4415  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>