49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0841 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0841  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  139  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0431891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1536  XRE family transcriptional regulator  73.44 
 
 
105 aa  107  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.793365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1818  XRE family transcriptional regulator  61.19 
 
 
107 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000178339  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1845  transcriptional regulator, XRE family  55.38 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0156  XRE family transcriptional regulator  63.49 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551998  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0164  transcriptional regulator, XRE family  56.72 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.862423  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1811  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7082  transcriptional regulator, XRE family  50.75 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2546  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2087  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2181  transcriptional regulator, XRE family  54.84 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4312  transcriptional regulator, XRE family  52.54 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0881286  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2974  XRE family transcriptional regulator  55.17 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3644  DNA-binding protein  45.59 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1782  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1503  putative DNA-binding protein  41.79 
 
 
107 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.114051  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5091  putative DNA-binding protein  42.62 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0262962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1246  transcriptional regulator-like protein  47.46 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4027  putative DNA-binding protein  42.62 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.678777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1497  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.243266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4109  DNA-binding protein  39.39 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3694  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
107 aa  57.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.516749  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4004  DNA-binding protein  39.39 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4174  DNA-binding protein  39.39 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0638  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0606399  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1232  transcriptional regulator protein  45 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0056  putative DNA-binding protein  47.17 
 
 
114 aa  57  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000362045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0794  DNA-binding protein  44.83 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2627  transcriptional regulator  47.46 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0561718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4706  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0024  DNA-binding protein  45.28 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.31955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4058  DNA-binding protein  37.88 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326996  normal  0.47831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3986  DNA-binding protein  37.88 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0763  Cro/CI family transcriptional regulator-related protein  42.37 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1405  hypothetical protein  41.94 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.923263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6333  transcriptional regulator-like  33.87 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0125  hypothetical protein  32.26 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2978  transcriptional regulator-like protein  33.87 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2356  hypothetical protein  56.41 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3004  transcriptional regulator-like protein  33.87 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2370  transcriptional regulator-like  33.87 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2984  transcriptional regulator-like protein  33.87 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1290  hypothetical protein  43.1 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.91858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00074  DNA-binding protein  36.67 
 
 
101 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3031  transcriptional regulator-like protein  32.26 
 
 
106 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2894  transcriptional regulator-like protein  32.26 
 
 
106 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4237  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2677  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0850  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.07607  normal  0.76733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>