79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1614 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1614  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 330 aa  662    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2053  glycosyl transferase group 1  60.75 
 
 		 319 aa  339  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1755  glycosyl transferase, group 1  53.61 
 
 		 327 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.66004  normal  0.478923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1726  glycosyl transferase group 1  56.53 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241877 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0614  glycosyltransferase  43.12 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5440  glycosyl transferase group 1  38.77 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0565  glycosyl transferase group 1  39.08 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2208  glycosyl transferase, group 1  37.92 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0393542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1739  glycosyl transferase group 1  38.23 
 
 		 317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1666  glycosyl transferase group 1  37.69 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1445  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0315  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 339 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0333  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.279236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.79 
 
 		 249 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 401 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 414 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 339 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 		 417 aa  49.3  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0588  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.147569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3586  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3659  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.650107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3591  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 		 404 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 411 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0297  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.61 
 
 		 355 aa  46.2  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 419 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  36.59 
 
 		 375 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  36.59 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  36.3 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 904 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  36.3 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 		 419 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 		 386 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.86 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  26.46 
 
 		 417 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 1991 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 384 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 		 439 aa  43.1  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 360 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 415 aa  42.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 396 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4202  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.66 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  35.09 
 
 		 381 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 		 376 aa  42.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1207  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 323 aa  42.4  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  0.0214801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 392 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>