More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1315 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  60.68 
 
 		 886 aa  876    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  59.5 
 
 		 727 aa  863    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  54.77 
 
 		 727 aa  763    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  54.94 
 
 		 723 aa  765    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  60.68 
 
 		 886 aa  876    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  52.81 
 
 		 751 aa  763    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  58.47 
 
 		 744 aa  818    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  60.94 
 
 		 878 aa  862    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  55.19 
 
 		 746 aa  764    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  62.1 
 
 		 755 aa  876    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 722 aa  1460    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  60.16 
 
 		 743 aa  879    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  60.66 
 
 		 883 aa  863    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  53.31 
 
 		 730 aa  739    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  50.77 
 
 		 871 aa  706    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  54.94 
 
 		 730 aa  776    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  59.53 
 
 		 741 aa  855    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  59 
 
 		 748 aa  806    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  56.17 
 
 		 723 aa  793    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  42.24 
 
 		 856 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  44.31 
 
 		 855 aa  495  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  41.77 
 
 		 875 aa  489  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  41.78 
 
 		 865 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  41.89 
 
 		 861 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  41.89 
 
 		 861 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  41.39 
 
 		 856 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  41.3 
 
 		 896 aa  481  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  41.76 
 
 		 856 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  41.92 
 
 		 858 aa  478  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  43.03 
 
 		 890 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  42.63 
 
 		 862 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  39.47 
 
 		 857 aa  465  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  42.38 
 
 		 855 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  41.08 
 
 		 856 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  41.47 
 
 		 879 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  38.18 
 
 		 895 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  41.47 
 
 		 855 aa  459  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  41.47 
 
 		 855 aa  459  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  36.14 
 
 		 894 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  38.37 
 
 		 885 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  41.55 
 
 		 861 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  36.04 
 
 		 876 aa  445  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  42.41 
 
 		 872 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  37.21 
 
 		 894 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  37.6 
 
 		 901 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  38.83 
 
 		 908 aa  437  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  36.1 
 
 		 877 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  35.97 
 
 		 877 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  36.28 
 
 		 902 aa  436  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  37.47 
 
 		 879 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  38.8 
 
 		 914 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  37.89 
 
 		 900 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  36.57 
 
 		 906 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  34.72 
 
 		 882 aa  412  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  37 
 
 		 918 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  35.63 
 
 		 910 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  35.75 
 
 		 939 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  38.24 
 
 		 881 aa  402  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  35.15 
 
 		 893 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  33.56 
 
 		 887 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  29.78 
 
 		 874 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  29.63 
 
 		 874 aa  349  9e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  32.23 
 
 		 622 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.18 
 
 		 636 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  29.74 
 
 		 637 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  28.91 
 
 		 646 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  34.22 
 
 		 664 aa  160  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  25.71 
 
 		 573 aa  156  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  31.21 
 
 		 647 aa  154  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.64 
 
 		 778 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.34 
 
 		 778 aa  154  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 		 593 aa  140  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  31.63 
 
 		 328 aa  135  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.98 
 
 		 757 aa  133  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 1103 aa  133  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  32.38 
 
 		 588 aa  130  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  34.79 
 
 		 594 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.91 
 
 		 755 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.56 
 
 		 755 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  33.14 
 
 		 579 aa  124  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  32.94 
 
 		 579 aa  124  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  33.44 
 
 		 571 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  33.04 
 
 		 585 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  31.38 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  33.12 
 
 		 569 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  30.89 
 
 		 595 aa  120  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  26.9 
 
 		 1086 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 		 593 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  31.96 
 
 		 585 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  30.82 
 
 		 572 aa  117  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 		 588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  29.62 
 
 		 582 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  29.62 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 		 581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  28.79 
 
 		 612 aa  111  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  30.46 
 
 		 584 aa  111  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  29.38 
 
 		 597 aa  111  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  31.25 
 
 		 581 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0257  cyanophycin synthetase-like  27.9 
 
 		 333 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000601246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.66 
 
 		 754 aa  107  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>