More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5831 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3557  amino acid permease-associated region  69.81 
 
 		 551 aa  755    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3293  amino acid permease-associated region  69.2 
 
 		 555 aa  764    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3183  amino acid permease-associated region  55.49 
 
 		 560 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.577712  normal  0.0276792 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0996  amino acid permease  68.82 
 
 		 551 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858254  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0481  putative amino acid transporter  68.82 
 
 		 551 aa  751    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.483178  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5964  amino acid permease-associated region  57.62 
 
 		 559 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5075  amino acid permease-associated region  70.77 
 
 		 551 aa  764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5831  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 545 aa  1102    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2118  hypothetical protein  68.82 
 
 		 551 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.755576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0838  amino acid permease  68.63 
 
 		 551 aa  748    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0581  amino acid transporter  70.19 
 
 		 551 aa  760    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1858  amino acid transporter, putative  69.19 
 
 		 551 aa  753    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540964  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5012  amino acid permease-associated region  70 
 
 		 551 aa  760    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3293  amino acid permease-associated region  70.77 
 
 		 551 aa  764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0700  amino acid permease  68.82 
 
 		 551 aa  751    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4239  amino acid permease-associated region  69.26 
 
 		 551 aa  757    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5210  amino acid permease-associated region  70.96 
 
 		 551 aa  765    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0750  amino acid permease  68.82 
 
 		 551 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4487  amino acid permease-associated region  69.81 
 
 		 551 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5970  amino acid permease-associated region  65.47 
 
 		 546 aa  703    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699386  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1969  amino acid permease  68.82 
 
 		 551 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0446  amino acid permease-associated region  55.03 
 
 		 562 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000198962  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3606  amino acid permease-associated region  49.08 
 
 		 571 aa  528  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0922  amino acid permease-associated region  48.29 
 
 		 571 aa  528  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5657  amino acid permease-associated region  45.96 
 
 		 594 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6593  amino acid permease-associated region  45.61 
 
 		 594 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3317  amino acid permease-associated region  44.79 
 
 		 594 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23200  amino acid transporter  39.92 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3606  amino acid permease  28.35 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.582205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2292  amino acid transporter  27.85 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5040  Amino acid transporter-like protein  30.17 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  23.59 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  22.56 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1820  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  26.55 
 
 		 483 aa  67  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  23.84 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  24.81 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  21.04 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  26.3 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 491 aa  60.1  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.33 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  25.52 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  25.48 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  22.83 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.33 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.33 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.33 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.33 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  21.77 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  24.06 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  24.33 
 
 		 467 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.57 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  20.66 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  21.76 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  23.8 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  22.44 
 
 		 549 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  25.97 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  25.97 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 503 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  24.16 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  24.47 
 
 		 465 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 440 aa  55.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  22.94 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  23.81 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  22.94 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2657  arginine/ornithine antiporter  23.53 
 
 		 476 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2713  arginine/ornithine antiporter  23.53 
 
 		 476 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 		 614 aa  54.3  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2130  amino acid permease-associated region  22.91 
 
 		 643 aa  54.3  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.345831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  24.06 
 
 		 467 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  23.5 
 
 		 474 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  21.84 
 
 		 427 aa  53.9  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1223  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 490 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 500 aa  53.9  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 486 aa  53.9  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  23.96 
 
 		 543 aa  53.5  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  24.11 
 
 		 465 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  24.11 
 
 		 465 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  24.11 
 
 		 465 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  23.67 
 
 		 465 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>