More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0159 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  98.95 
 
 
478 aa  921    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  100 
 
 
478 aa  931    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  57.17 
 
 
472 aa  527  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06670  arginine/ornithine antiporter  57.05 
 
 
480 aa  502  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.477443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0474  arginine/ornithine antiporter  58.53 
 
 
471 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  58.95 
 
 
471 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4896  arginine/ornithine antiporter  58.74 
 
 
471 aa  498  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.782908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0422  arginine/ornithine antiporter  58.74 
 
 
471 aa  498  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  58.74 
 
 
471 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  54.76 
 
 
475 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2264  arginine/ornithine antiporter  56.03 
 
 
475 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1002  arginine/ornithine antiporter  54.74 
 
 
475 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2315  arginine/ornithine antiporter  55.18 
 
 
471 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2391  arginine/ornithine antiporter  55.18 
 
 
471 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2127  arginine/ornithine antiporter  55.18 
 
 
475 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2065  arginine/ornithine antiporter  55.18 
 
 
475 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00119125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2307  arginine/ornithine antiporter  55.18 
 
 
475 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2061  arginine/ornithine antiporter  55.18 
 
 
475 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.111642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2281  arginine/ornithine antiporter  55.18 
 
 
475 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1039  arginine/ornithine antiporter  54.74 
 
 
475 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808656  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  54.12 
 
 
475 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0350  arginine/ornithine antiporter  58.4 
 
 
471 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4222  arginine/ornithine antiporter  54.32 
 
 
475 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3061  arginine/ornithine antiporter  54.76 
 
 
475 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2166  arginine/ornithine antiporter  49.89 
 
 
475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1001  arginine/ornithine antiporter  54.53 
 
 
475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2683  arginine/ornithine antiporter  53.5 
 
 
475 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4385  arginine/ornithine antiporter  54.35 
 
 
475 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2383  arginine/ornithine antiporter  52.32 
 
 
486 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.646333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1089  arginine/ornithine antiporter  52.44 
 
 
493 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.505428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2660  arginine/ornithine antiporter  53.8 
 
 
475 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0916  arginine/ornithine antiporter  52.64 
 
 
486 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1144  arginine/ornithine antiporter  52.64 
 
 
486 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2129  arginine/ornithine antiporter  52.76 
 
 
506 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1109  arginine/ornithine antiporter  52.1 
 
 
475 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.28189 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1988  arginine/ornithine antiporter  52.64 
 
 
486 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4536  arginine/ornithine antiporter  52.11 
 
 
484 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1584  arginine/ornithine antiporter  52.76 
 
 
506 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0243  arginine/ornithine antiporter  52.64 
 
 
486 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1969  arginine/ornithine antiporter  52.64 
 
 
486 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2247  arginine/ornithine antiporter  50.75 
 
 
467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4384  arginine/ornithine antiporter  50.95 
 
 
475 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.669533  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68300  arginine/ornithine antiporter  52.59 
 
 
482 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000378428  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5910  arginine/ornithine antiporter  52.17 
 
 
482 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0569669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2713  arginine/ornithine antiporter  52.07 
 
 
476 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2657  arginine/ornithine antiporter  52.07 
 
 
476 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5574  arginine/ornithine antiporter  53 
 
 
493 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4221  arginine/ornithine antiporter  52.29 
 
 
475 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1003  arginine/ornithine antiporter  52.32 
 
 
475 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1040  arginine/ornithine antiporter  52.32 
 
 
480 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188854  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1878  arginine/ornithine APC family antiporter  53.1 
 
 
493 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0072  amino acid permease  52.17 
 
 
671 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137456  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1484  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  51.94 
 
 
496 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0574434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1002  arginine/ornithine antiporter  52.32 
 
 
475 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1392  arginine/ornithine antiporter  51.14 
 
 
496 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.679815 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1571  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  51.71 
 
 
663 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0188747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2174  arginine/ornithine antiporter  50.74 
 
 
492 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2423  arginine/ornithine antiporter  49.44 
 
 
489 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2905  arginine/ornithine antiporter  46.07 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2851  arginine/ornithine antiporter  47.37 
 
 
468 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000722534  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0744  arginine/ornithine antiporter  42.8 
 
 
503 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19660  amino acid transporter  45.39 
 
 
489 aa  391  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.598137  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1813  putative arginine/ornithine antiporter  45.24 
 
 
460 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00102354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01574  predicted arginine/ornithine antiporter transporter  45.24 
 
 
460 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.424719  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2025  arginine/ornithine antiporter  45.24 
 
 
460 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2038  arginine/ornithine antiporter  45.24 
 
 
460 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000756362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2315  arginine/ornithine antiporter  45.24 
 
 
460 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222235  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1680  putative arginine/ornithine antiporter  45.24 
 
 
460 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.982096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01564  hypothetical protein  45.24 
 
 
460 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.358572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1594  arginine/ornithine antiporter  45.24 
 
 
460 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132259  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2906  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 
500 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1791  arginine/ornithine antiporter  45.02 
 
 
460 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0468427  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04620  amino acid transporter  45.76 
 
 
488 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2970  amino acid permease-associated region  44.44 
 
 
494 aa  378  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1586  arginine/ornithine antiporter  45.74 
 
 
460 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916366  normal  0.560128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1577  arginine/ornithine antiporter  45.74 
 
 
460 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933609  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1645  arginine/ornithine antiporter  45.53 
 
 
460 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.498381  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1697  arginine/ornithine antiporter  45.74 
 
 
460 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2587  arginine/ornithine antiporter  45.39 
 
 
463 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1847  arginine/ornithine antiporter  45.01 
 
 
460 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.861199  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2298  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  47.17 
 
 
463 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.552138 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1939  arginine/ornithine antiporter  47.17 
 
 
463 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1828  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  47.17 
 
 
463 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.768875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0377  putative arginine/ornithine antiporter  42.68 
 
 
481 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14000  amino acid transporter  41.6 
 
 
495 aa  361  1e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0372  arginine/ornithine antiporter  42.26 
 
 
481 aa  359  7e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4184  amino acid permease  44.22 
 
 
472 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48850  amino acid permease  44.12 
 
 
472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176582  hitchhiker  0.0000000102328 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2500  amino acid permease-associated region  39.62 
 
 
499 aa  351  2e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1038  amino acid permease  46.91 
 
 
451 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.200212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1190  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  46.91 
 
 
451 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.430396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0019  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  46.91 
 
 
451 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.991696  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0393  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  46.91 
 
 
451 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1498  amino acid permease-associated region  43.02 
 
 
445 aa  349  8e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333437  normal  0.389664 
 
 
-
 
NC_002620  TC0653  amino acid permease  42.02 
 
 
483 aa  334  3e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3864  amino acid permease-associated region  44.19 
 
 
465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000323953  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2320  amino acid transporter  39.74 
 
 
526 aa  322  9.000000000000001e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3099  amino acid permease-associated region  44.54 
 
 
466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1278  amino acid permease-associated region  44.32 
 
 
466 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0546125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3089  amino acid permease-associated region  44.32 
 
 
466 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>