82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5575 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5575  surface antigen protein  100 
 
 		 217 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3644  surface antigen precursor  71.83 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  46.25 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  46.25 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  46.25 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  46.25 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  46.25 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  46.25 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  46.25 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  38.91 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  38.91 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  54.39 
 
 		 168 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  54.39 
 
 		 163 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  40.51 
 
 		 208 aa  92  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  40.96 
 
 		 204 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  38.29 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  55.26 
 
 		 167 aa  89.4  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  35.65 
 
 		 272 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  36.44 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00385  putative glycin-rich transmembrane protein  46.07 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2480  17 kDa surface antigen-like protein  44.13 
 
 		 177 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  42.42 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4697  17 kDa surface antigen  46.84 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333957  normal  0.0653539 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3620  17 kDa surface antigen  46.84 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  52.27 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  44.08 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  36.19 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  38.51 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0072  17 kDa surface antigen  54.13 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  44.44 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  44.44 
 
 		 165 aa  72  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  40.27 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  40.37 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  41.06 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  37.84 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  41.72 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  47.52 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  42.31 
 
 		 157 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  55.81 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  38 
 
 		 166 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  57.14 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  54.35 
 
 		 171 aa  48.9  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  57.14 
 
 		 175 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  34.62 
 
 		 155 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  52.38 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  52.38 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  52.38 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  52.38 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  52.38 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  52.38 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  52.38 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  52.38 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1103  hypothetical protein  46.3 
 
 		 412 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  52.38 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  45.59 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  32.43 
 
 		 164 aa  45.1  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  35.14 
 
 		 685 aa  45.1  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  38.67 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04811  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.69 
 
 		 159 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  41.43 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  61.9 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  61.9 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  61.9 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  30.56 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  47.73 
 
 		 376 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  59.52 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  30.88 
 
 		 349 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  35.29 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  46.75 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  61.9 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1560  hypothetical protein  43.51 
 
 		 241 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.24397  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  41.79 
 
 		 158 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0358  17 kDa surface antigen  47.62 
 
 		 124 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  61.9 
 
 		 179 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2648  17 kDa surface antigen  37.84 
 
 		 164 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2598  Forkhead-associated protein  59.46 
 
 		 350 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  37.93 
 
 		 177 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>