More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1821 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1821  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 652 aa  1320    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7333  AMP-dependent synthetase and ligase  70.16 
 
 		 650 aa  938    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6450  AMP-dependent synthetase and ligase  50.16 
 
 		 650 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  hitchhiker  0.0000000000000110833 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1428  AMP-dependent synthetase and ligase  49.61 
 
 		 640 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922087  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6401  AMP-dependent synthetase and ligase  49.61 
 
 		 640 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  40.85 
 
 		 642 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  41.09 
 
 		 663 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  41.19 
 
 		 641 aa  476  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  39.08 
 
 		 646 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  38.71 
 
 		 646 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.24 
 
 		 646 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 		 646 aa  465  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  38.5 
 
 		 646 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.08 
 
 		 646 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  39.08 
 
 		 646 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  38.92 
 
 		 646 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  39.08 
 
 		 646 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.08 
 
 		 646 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  38.92 
 
 		 646 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 		 670 aa  432  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 		 668 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 608 aa  424  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 		 643 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0166  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 		 623 aa  397  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 694 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 674 aa  388  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 663 aa  383  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  35.3 
 
 		 670 aa  385  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 641 aa  379  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0200095  normal  0.25307 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  34.63 
 
 		 670 aa  360  5e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  34.27 
 
 		 653 aa  348  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  33.71 
 
 		 636 aa  348  3e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  33.39 
 
 		 636 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  32.97 
 
 		 650 aa  346  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  34.62 
 
 		 667 aa  346  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  34.8 
 
 		 656 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  33.59 
 
 		 660 aa  343  4e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  32.34 
 
 		 650 aa  342  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  34.67 
 
 		 657 aa  341  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  35.42 
 
 		 654 aa  341  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  34.43 
 
 		 654 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  35.06 
 
 		 655 aa  340  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  32.83 
 
 		 638 aa  339  9.999999999999999e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  32.58 
 
 		 664 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  34.31 
 
 		 639 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  34.08 
 
 		 638 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  34.07 
 
 		 632 aa  336  5.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 655 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  34.2 
 
 		 650 aa  335  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  32.42 
 
 		 636 aa  335  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  33.8 
 
 		 667 aa  335  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  33.44 
 
 		 659 aa  334  3e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  34.13 
 
 		 666 aa  333  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  34.79 
 
 		 631 aa  333  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  35.22 
 
 		 656 aa  332  9e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 652 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  35.06 
 
 		 632 aa  331  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  33.01 
 
 		 652 aa  331  3e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  32.34 
 
 		 652 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  34.62 
 
 		 632 aa  330  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  34.62 
 
 		 632 aa  330  7e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  34.31 
 
 		 639 aa  329  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19340  acetyl-coenzyme A synthetase  36.13 
 
 		 741 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.101237  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  34.46 
 
 		 658 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  32.96 
 
 		 626 aa  329  1.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  36.83 
 
 		 674 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  33.38 
 
 		 661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  35.75 
 
 		 658 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  34.13 
 
 		 651 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  35.57 
 
 		 655 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  35.66 
 
 		 631 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  32.3 
 
 		 663 aa  326  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  33.07 
 
 		 667 aa  327  6e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 666 aa  326  9e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  34.19 
 
 		 652 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  33.7 
 
 		 657 aa  324  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  33.71 
 
 		 649 aa  324  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  32.97 
 
 		 667 aa  324  3e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  36.16 
 
 		 629 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  34.02 
 
 		 649 aa  322  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  33.02 
 
 		 648 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  34.23 
 
 		 655 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  34.02 
 
 		 654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  33.44 
 
 		 658 aa  321  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  32.36 
 
 		 652 aa  321  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  33.87 
 
 		 660 aa  321  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  34.55 
 
 		 658 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  33.59 
 
 		 646 aa  320  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  34.65 
 
 		 661 aa  319  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 		 627 aa  319  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  32.85 
 
 		 664 aa  318  1e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  31.39 
 
 		 656 aa  318  1e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  33.88 
 
 		 643 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  34.78 
 
 		 661 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  32.97 
 
 		 649 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  33.02 
 
 		 644 aa  318  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  35.13 
 
 		 651 aa  318  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  32.61 
 
 		 666 aa  317  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  34.09 
 
 		 656 aa  318  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>