244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1206 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1206  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  324  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  37.09 
 
 
151 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  35.76 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  35.76 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  37.84 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  33.78 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4517  universal stress protein  39.86 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0300457  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  28.08 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  27.4 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  27.4 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  33.55 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  27.89 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  29.66 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  29.73 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  32.5 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  29.73 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  28.77 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  31.47 
 
 
315 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  32.43 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
163 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  33.77 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  33.77 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  26.39 
 
 
187 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  27.08 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.14 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  29.75 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  27.78 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  27.78 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  26.39 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  29.75 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  28.93 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  28.08 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  27.78 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  27.78 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  27.78 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  27.78 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  31.08 
 
 
201 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  31.08 
 
 
191 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  35.76 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  27.78 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  27.7 
 
 
168 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32 
 
 
280 aa  58.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  31.08 
 
 
201 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  30 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  30.14 
 
 
156 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  31.08 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  30.14 
 
 
156 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.92 
 
 
156 aa  57.4  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  30.14 
 
 
156 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  31.08 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  30.14 
 
 
200 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  30.14 
 
 
156 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  30.14 
 
 
156 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  31.08 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  28.86 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  29.53 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  27.4 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  26.03 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  30.97 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  31.69 
 
 
319 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.38 
 
 
286 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  31.69 
 
 
315 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  31.69 
 
 
315 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  31.25 
 
 
301 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  24.85 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.56 
 
 
294 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  27.78 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  26.17 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  30.64 
 
 
325 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0898  UspA domain protein  33.33 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  29.73 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0751  universal stress family protein  33.33 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  26.71 
 
 
140 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  27.81 
 
 
295 aa  53.9  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  53.9  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  29.61 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>