207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2484 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2484  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  735    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1066  major facilitator transporter  89.44 
 
 		 391 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1320  major facilitator superfamily MFS_1  58.04 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  hitchhiker  0.000000456317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  27.72 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  28.76 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  28.5 
 
 		 403 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  29.09 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  28.24 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  28.24 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  28.24 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  28.24 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  28.5 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  29.02 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  29.25 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 421 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  29.53 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  29.17 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  29.17 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  29.17 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  29.17 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  29.17 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  29.17 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  29.17 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  26.85 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  28.68 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 380 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  28 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 388 aa  87  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1552  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00281859  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  29.7 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  32.78 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  30.75 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  27.91 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  28.02 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  30.54 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  27.53 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  26.35 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  25.68 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0053  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>