84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2764 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  66.3 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  66.67 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  66.67 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  58.43 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  53.85 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  56.52 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  53.16 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  52.22 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  48.35 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  46.43 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  46.43 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  46.43 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  43.43 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  43.43 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  43.43 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  47.67 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  48.61 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  45.57 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  45.45 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  42.35 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  60.98 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  44.05 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  64.1 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  52.63 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  64.86 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  46.03 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  55.81 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  63.89 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  39.13 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  39.13 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  39.74 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  61.76 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  41.1 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  41.03 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  42.11 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  42.11 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  39.73 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  42.86 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  41.03 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  38.16 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  46.03 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  38.3 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  38.64 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  60 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  35.05 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  53.49 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  45 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  53.49 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  37.21 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  36.17 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  36.05 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  59.38 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  46.51 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  48.84 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  43.84 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  54.29 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  43.04 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  32.93 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  51.28 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  62.5 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  52.38 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  34.52 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  58.54 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  51.43 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  43.04 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  35.37 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  51.43 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  32.14 
 
 		 79 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  46.15 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  48.57 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  40.51 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  48.57 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  48.57 
 
 		 89 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  48.57 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  34.52 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  51.52 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  51.52 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  29.79 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1806  hypothetical protein  31.25 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.832852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2194  hypothetical protein  54.84 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  29.79 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>