281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0158 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0158  cellulose synthase-like protein  100 
 
 
627 aa  1261    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1333  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  83.73 
 
 
627 aa  1035    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1792  cellulose synthase-like protein  99.36 
 
 
627 aa  1251    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.643203 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3671  putative cellulose synthase protein  53.32 
 
 
618 aa  635  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484697  hitchhiker  0.0086159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4415  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.93 
 
 
616 aa  622  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0207  putative cellulose synthase protein  52.25 
 
 
635 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.489481  normal  0.127812 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0544  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.34 
 
 
614 aa  589  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374359  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4003  putative cellulose synthase protein  51.29 
 
 
622 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4332  putative cellulose synthase protein  51.59 
 
 
622 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00407382  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  50.57 
 
 
880 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  50 
 
 
886 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2257  putative transmembrane cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.32 
 
 
617 aa  243  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3905  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.29 
 
 
570 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504805  normal  0.221865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7195  putative glycosyl transferase  26.74 
 
 
888 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.82 
 
 
980 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
1231 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
1140 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
579 aa  94.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  28.7 
 
 
716 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
1140 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  27.2 
 
 
683 aa  91.7  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  22.76 
 
 
591 aa  90.5  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  27.46 
 
 
624 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
620 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
1140 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  29.73 
 
 
712 aa  88.2  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  23.57 
 
 
547 aa  87.4  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
1129 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.15 
 
 
544 aa  84  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25 
 
 
831 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  23.91 
 
 
741 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  25.76 
 
 
749 aa  82.8  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.36 
 
 
652 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.14 
 
 
586 aa  82.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.68 
 
 
804 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.62 
 
 
1099 aa  82.4  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.3 
 
 
930 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
772 aa  80.5  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.95 
 
 
810 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  25.25 
 
 
501 aa  80.5  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.79 
 
 
834 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.11 
 
 
652 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.11 
 
 
768 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25 
 
 
822 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.8 
 
 
811 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  26.05 
 
 
652 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  22.14 
 
 
740 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  22.17 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  24.8 
 
 
514 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  23.2 
 
 
737 aa  77.4  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1828  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.22 
 
 
656 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
859 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
610 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  22.2 
 
 
726 aa  74.3  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  22.65 
 
 
905 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
476 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  24.69 
 
 
666 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  23.65 
 
 
650 aa  72  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4186  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
537 aa  71.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  23.81 
 
 
661 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.85 
 
 
702 aa  71.2  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 
885 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  22.38 
 
 
659 aa  70.9  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  23.87 
 
 
863 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  25.85 
 
 
699 aa  70.1  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.63 
 
 
730 aa  70.5  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.69 
 
 
696 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.65 
 
 
794 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
862 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
863 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  24.72 
 
 
752 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 
509 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
420 aa  70.1  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.3 
 
 
672 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
863 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  24.44 
 
 
564 aa  69.3  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  23.27 
 
 
734 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  22.1 
 
 
718 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  24.3 
 
 
672 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  25.31 
 
 
788 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.05 
 
 
633 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.36 
 
 
846 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  25.31 
 
 
788 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  25.43 
 
 
729 aa  68.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  23.09 
 
 
889 aa  67.4  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  23.64 
 
 
855 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
520 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
520 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
520 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.11 
 
 
730 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  23.08 
 
 
845 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.41 
 
 
773 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  26.08 
 
 
514 aa  66.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  22.51 
 
 
909 aa  65.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  22.65 
 
 
889 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.67 
 
 
851 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3450  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.75 
 
 
659 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.27 
 
 
1135 aa  65.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>