261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4003 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0544  glycosyl transferase, group 2 family protein  58.77 
 
 		 614 aa  702    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374359  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0207  putative cellulose synthase protein  58.02 
 
 		 635 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.489481  normal  0.127812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4003  putative cellulose synthase protein  100 
 
 		 622 aa  1266    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3671  putative cellulose synthase protein  60.43 
 
 		 618 aa  721    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484697  hitchhiker  0.0086159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4332  putative cellulose synthase protein  86.47 
 
 		 622 aa  1066    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00407382  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4415  glycosyl transferase, group 2 family protein  57.75 
 
 		 616 aa  680    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160191  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0158  cellulose synthase-like protein  51.89 
 
 		 627 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1792  cellulose synthase-like protein  52.35 
 
 		 627 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.643203 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  54.71 
 
 		 880 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  54.12 
 
 		 886 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1333  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  53.31 
 
 		 627 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2257  putative transmembrane cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.96 
 
 		 617 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3905  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.43 
 
 		 570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504805  normal  0.221865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7195  putative glycosyl transferase  29.35 
 
 		 888 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.55 
 
 		 980 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 1231 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.43 
 
 		 544 aa  97.8  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 		 547 aa  90.5  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  27.78 
 
 		 624 aa  87.8  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 620 aa  87.4  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  25.06 
 
 		 564 aa  83.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  25.16 
 
 		 712 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  22.57 
 
 		 718 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  27.29 
 
 		 1140 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 		 591 aa  80.9  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  27.97 
 
 		 716 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  25.76 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  26.95 
 
 		 672 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 1140 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.03 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  21.81 
 
 		 737 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.64 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.75 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  26.42 
 
 		 666 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 		 610 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 752 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  21.12 
 
 		 741 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  26.56 
 
 		 729 aa  73.6  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.4 
 
 		 810 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 		 772 aa  73.6  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  24.12 
 
 		 855 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 1140 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  21.19 
 
 		 740 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 1129 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  23.22 
 
 		 501 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.3 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  22.47 
 
 		 665 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  29.65 
 
 		 788 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  26.3 
 
 		 661 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  24.52 
 
 		 909 aa  72  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  29.65 
 
 		 788 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 514 aa  72  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.27 
 
 		 930 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.25 
 
 		 1099 aa  70.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  24.52 
 
 		 726 aa  70.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  22.77 
 
 		 683 aa  69.7  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.92 
 
 		 702 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 		 579 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  24.32 
 
 		 699 aa  68.2  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.15 
 
 		 696 aa  68.2  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  25.45 
 
 		 778 aa  67.8  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  26.85 
 
 		 788 aa  67.4  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  25.31 
 
 		 739 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  23.74 
 
 		 872 aa  66.6  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  24.5 
 
 		 652 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  23.26 
 
 		 869 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.5 
 
 		 652 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  22.92 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.97 
 
 		 811 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.71 
 
 		 664 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  24.33 
 
 		 749 aa  65.1  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  24.34 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  24.79 
 
 		 874 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  26.11 
 
 		 872 aa  65.1  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.74 
 
 		 730 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  24.79 
 
 		 874 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  31.1 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  24.79 
 
 		 874 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.1 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  24.79 
 
 		 874 aa  64.3  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 859 aa  64.3  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  24.52 
 
 		 874 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  30.06 
 
 		 662 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.97 
 
 		 804 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  24.11 
 
 		 869 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.84 
 
 		 872 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  30.63 
 
 		 633 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.24 
 
 		 845 aa  62  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 		 905 aa  62  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  24.84 
 
 		 872 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  24.84 
 
 		 872 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  25.8 
 
 		 872 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>