254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4332 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0544  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.11 
 
 
614 aa  699    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374359  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4332  putative cellulose synthase protein  100 
 
 
622 aa  1264    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00407382  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0207  putative cellulose synthase protein  58.7 
 
 
635 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.489481  normal  0.127812 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4415  glycosyl transferase, group 2 family protein  57.21 
 
 
616 aa  676    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4003  putative cellulose synthase protein  86.47 
 
 
622 aa  1065    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3671  putative cellulose synthase protein  60.1 
 
 
618 aa  722    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484697  hitchhiker  0.0086159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0158  cellulose synthase-like protein  51.86 
 
 
627 aa  568  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1792  cellulose synthase-like protein  51.86 
 
 
627 aa  568  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.643203 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  51.98 
 
 
886 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  52.85 
 
 
880 aa  558  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1333  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  53.17 
 
 
627 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2257  putative transmembrane cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.29 
 
 
617 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3905  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.37 
 
 
570 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504805  normal  0.221865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7195  putative glycosyl transferase  29.09 
 
 
888 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.62 
 
 
980 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
1231 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 
547 aa  89.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.17 
 
 
544 aa  89.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
620 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  27.66 
 
 
624 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
1140 aa  87  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
591 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.07 
 
 
718 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
772 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  25.17 
 
 
564 aa  83.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  25.62 
 
 
712 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
1140 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  25.76 
 
 
514 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  28.44 
 
 
716 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
1140 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  21.83 
 
 
737 aa  77.8  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
1129 aa  77.8  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  22.64 
 
 
501 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  21.94 
 
 
740 aa  75.5  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.62 
 
 
586 aa  75.1  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 
610 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  24.16 
 
 
683 aa  74.7  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 
650 aa  74.3  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  22.09 
 
 
665 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.48 
 
 
672 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  25.15 
 
 
729 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 
752 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  26.05 
 
 
672 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  22.61 
 
 
741 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.08 
 
 
810 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  27.39 
 
 
872 aa  72  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  26.53 
 
 
666 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30 
 
 
1099 aa  71.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.1 
 
 
672 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  23.82 
 
 
661 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  27.08 
 
 
788 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  26.92 
 
 
749 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  27.08 
 
 
788 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  27.07 
 
 
872 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.07 
 
 
872 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 
579 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  27.07 
 
 
872 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  27.07 
 
 
872 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  23.53 
 
 
909 aa  69.7  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  27.07 
 
 
872 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  27.07 
 
 
872 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  22.39 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.51 
 
 
930 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  27.07 
 
 
872 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  28.57 
 
 
872 aa  67.8  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
509 aa  67  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  26.88 
 
 
778 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  23.81 
 
 
699 aa  67  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  27.59 
 
 
726 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  24.3 
 
 
664 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  23.43 
 
 
707 aa  66.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
514 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.15 
 
 
702 aa  66.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  27.01 
 
 
874 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  26.39 
 
 
788 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.91 
 
 
811 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
520 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
905 aa  65.1  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  27.46 
 
 
869 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
520 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
520 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  26.86 
 
 
739 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  25.4 
 
 
874 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  25.4 
 
 
874 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.45 
 
 
664 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  25.4 
 
 
874 aa  64.3  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  31.1 
 
 
520 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  25.4 
 
 
874 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.89 
 
 
730 aa  63.9  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.1 
 
 
505 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.65 
 
 
730 aa  63.9  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.8 
 
 
696 aa  63.9  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
885 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2832  cellulose synthase (UDP-forming)  25.12 
 
 
669 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  30.06 
 
 
662 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  30.72 
 
 
386 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  23.81 
 
 
872 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
476 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3450  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.41 
 
 
659 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>