239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7195 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7195  putative glycosyl transferase  100 
 
 
888 aa  1792    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3905  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  48.55 
 
 
570 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504805  normal  0.221865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2257  putative transmembrane cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.03 
 
 
617 aa  191  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
1231 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.12 
 
 
980 aa  159  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
620 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.18 
 
 
544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  25.66 
 
 
741 aa  144  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4332  putative cellulose synthase protein  27.97 
 
 
622 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00407382  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  26.98 
 
 
880 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.88 
 
 
586 aa  139  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4415  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.37 
 
 
616 aa  138  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1333  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.32 
 
 
627 aa  138  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4003  putative cellulose synthase protein  27.77 
 
 
622 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0207  putative cellulose synthase protein  25.82 
 
 
635 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.489481  normal  0.127812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  28.61 
 
 
591 aa  132  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  31.69 
 
 
716 aa  129  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3671  putative cellulose synthase protein  26.84 
 
 
618 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484697  hitchhiker  0.0086159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.26 
 
 
886 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0544  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.73 
 
 
614 aa  127  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
547 aa  126  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  31.23 
 
 
712 aa  125  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.83 
 
 
930 aa  125  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.89 
 
 
831 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0158  cellulose synthase-like protein  26.74 
 
 
627 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1792  cellulose synthase-like protein  26.52 
 
 
627 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.643203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.09 
 
 
834 aa  122  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  27.18 
 
 
778 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  26.61 
 
 
788 aa  118  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  27.32 
 
 
737 aa  118  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.95 
 
 
811 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  26.99 
 
 
564 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.38 
 
 
794 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.74 
 
 
804 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.37 
 
 
822 aa  114  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  28.21 
 
 
788 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  28.21 
 
 
788 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  28.77 
 
 
740 aa  110  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.29 
 
 
810 aa  107  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  27.55 
 
 
726 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  26.79 
 
 
749 aa  102  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25 
 
 
730 aa  102  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.85 
 
 
730 aa  101  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1116  cellulose synthase (UDP-forming)  36.36 
 
 
691 aa  102  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.772245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.77 
 
 
846 aa  101  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  24.93 
 
 
855 aa  101  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  25.62 
 
 
501 aa  100  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  22.76 
 
 
707 aa  100  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  26.14 
 
 
845 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3768  cellulose synthase (UDP-forming)  37.71 
 
 
677 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.092957  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 
845 aa  99.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.62 
 
 
734 aa  99  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  26.64 
 
 
846 aa  98.6  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  28.33 
 
 
867 aa  99  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 
848 aa  98.6  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.71 
 
 
768 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 
846 aa  98.6  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.53 
 
 
845 aa  98.6  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  25.53 
 
 
845 aa  98.6  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 
848 aa  98.6  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 
848 aa  98.6  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  26.64 
 
 
848 aa  98.2  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.42 
 
 
657 aa  97.8  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  23.79 
 
 
869 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  25.73 
 
 
874 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.92 
 
 
743 aa  97.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  28.42 
 
 
655 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  28.1 
 
 
734 aa  97.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.99 
 
 
718 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  25.73 
 
 
874 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.42 
 
 
657 aa  97.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  25.73 
 
 
874 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  25.73 
 
 
874 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  25.73 
 
 
874 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.77 
 
 
696 aa  96.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  28.42 
 
 
657 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  28.42 
 
 
655 aa  95.9  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  28.42 
 
 
655 aa  95.9  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  25.53 
 
 
1455 aa  95.9  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  28.42 
 
 
655 aa  95.9  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  27.51 
 
 
729 aa  95.5  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.54 
 
 
672 aa  94.4  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1828  Cellulose synthase (UDP-forming)  36.31 
 
 
656 aa  94.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  25.94 
 
 
739 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.77 
 
 
851 aa  93.6  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.54 
 
 
514 aa  94  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  26.5 
 
 
624 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.84 
 
 
845 aa  93.2  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  25 
 
 
899 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  24.31 
 
 
672 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  25.95 
 
 
872 aa  92.8  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  24.22 
 
 
869 aa  92  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  25.84 
 
 
845 aa  92  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  25.84 
 
 
845 aa  92  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  25.55 
 
 
699 aa  91.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  24.54 
 
 
899 aa  91.7  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.65 
 
 
702 aa  91.7  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  24.27 
 
 
872 aa  91.3  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>