240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3768 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2615  Cellulose synthase (UDP-forming)  55.52 
 
 
641 aa  649    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1828  Cellulose synthase (UDP-forming)  62.04 
 
 
656 aa  773    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3768  cellulose synthase (UDP-forming)  100 
 
 
677 aa  1369    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.092957  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0406  cellulose synthase (UDP-forming)  56.19 
 
 
658 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1116  cellulose synthase (UDP-forming)  88.06 
 
 
691 aa  1158    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.772245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2832  cellulose synthase (UDP-forming)  56.53 
 
 
669 aa  699    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0415  cellulose synthase (UDP-forming)  56.19 
 
 
658 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3450  Cellulose synthase (UDP-forming)  54.53 
 
 
659 aa  706    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0394  cellulose synthase (UDP-forming)  56.19 
 
 
658 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193019  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0281  cellulose synthase (UDP-forming)  59.16 
 
 
314 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0282  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  56.13 
 
 
341 aa  336  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  48.67 
 
 
665 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  49.79 
 
 
716 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  46.5 
 
 
712 aa  201  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  40.87 
 
 
696 aa  176  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  42.91 
 
 
869 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  40.48 
 
 
699 aa  176  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0321  putative glycosyl transferase  33.74 
 
 
620 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  41.27 
 
 
702 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  42.52 
 
 
869 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  42.46 
 
 
869 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  39.44 
 
 
739 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  38.89 
 
 
867 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  42.46 
 
 
1455 aa  168  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 
857 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  42.5 
 
 
846 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3128  cellulose synthase (UDP-forming)  35.85 
 
 
607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.887302  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  35.46 
 
 
741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  40.64 
 
 
855 aa  165  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.74 
 
 
851 aa  164  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  37.7 
 
 
899 aa  164  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  37.55 
 
 
874 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  37.55 
 
 
874 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  37.55 
 
 
874 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  37.55 
 
 
874 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  37.55 
 
 
874 aa  163  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  41.25 
 
 
845 aa  163  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  38.67 
 
 
899 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  41.25 
 
 
845 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  41.25 
 
 
845 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  38.04 
 
 
872 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  32.73 
 
 
872 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.73 
 
 
872 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  39.26 
 
 
743 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  32.73 
 
 
872 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  32.73 
 
 
872 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  32.73 
 
 
872 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  32.73 
 
 
872 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  32.73 
 
 
872 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.58 
 
 
734 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  36.11 
 
 
872 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  38.74 
 
 
734 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  42.08 
 
 
845 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  42.08 
 
 
845 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  36.47 
 
 
872 aa  156  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.08 
 
 
848 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.08 
 
 
846 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.08 
 
 
848 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  41.08 
 
 
846 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  41.08 
 
 
848 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.08 
 
 
848 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.66 
 
 
845 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  41.67 
 
 
845 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
1129 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0298  cellulose synthase (UDP-forming)  30.51 
 
 
618 aa  152  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.78317  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  34.67 
 
 
909 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  37.72 
 
 
758 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  41.62 
 
 
1140 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 
1140 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.26 
 
 
822 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  41.01 
 
 
664 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  37.16 
 
 
726 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.63 
 
 
834 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.63 
 
 
831 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  33.6 
 
 
737 aa  138  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  38.22 
 
 
778 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  34.62 
 
 
729 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  35.04 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  36.16 
 
 
788 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  36.16 
 
 
788 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  30.03 
 
 
666 aa  134  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  43.26 
 
 
1140 aa  133  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  43.79 
 
 
591 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.95 
 
 
811 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  39.78 
 
 
768 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  33.08 
 
 
664 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  35.42 
 
 
788 aa  132  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.87 
 
 
730 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.32 
 
 
810 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0708  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.17 
 
 
604 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.11 
 
 
804 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.16 
 
 
794 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.92 
 
 
672 aa  128  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.25 
 
 
730 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.29 
 
 
930 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  34.02 
 
 
740 aa  127  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.5 
 
 
672 aa  127  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 
659 aa  127  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
658 aa  127  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  32.5 
 
 
672 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>