139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0708 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0708  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
604 aa  1225    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0321  putative glycosyl transferase  40.75 
 
 
620 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0298  cellulose synthase (UDP-forming)  40.67 
 
 
618 aa  487  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.78317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3128  cellulose synthase (UDP-forming)  40.81 
 
 
607 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.887302  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  25.41 
 
 
665 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  27.64 
 
 
712 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1828  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.23 
 
 
656 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  27.95 
 
 
716 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3450  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.43 
 
 
659 aa  127  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3768  cellulose synthase (UDP-forming)  31.77 
 
 
677 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.092957  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1116  cellulose synthase (UDP-forming)  31.77 
 
 
691 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.772245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  25.7 
 
 
869 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2615  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.1 
 
 
641 aa  120  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0406  cellulose synthase (UDP-forming)  28.74 
 
 
658 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0415  cellulose synthase (UDP-forming)  28.74 
 
 
658 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0394  cellulose synthase (UDP-forming)  28.74 
 
 
658 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193019  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2832  cellulose synthase (UDP-forming)  30.43 
 
 
669 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  25.35 
 
 
869 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
857 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0281  cellulose synthase (UDP-forming)  28.3 
 
 
314 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  26.05 
 
 
869 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  22.77 
 
 
867 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  23.76 
 
 
741 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  24.8 
 
 
788 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  24.8 
 
 
788 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
1129 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  23.18 
 
 
874 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  23.18 
 
 
874 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.71 
 
 
845 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  23.48 
 
 
909 aa  102  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  23.01 
 
 
874 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  23.01 
 
 
874 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  23.01 
 
 
874 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  24.61 
 
 
846 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  24.7 
 
 
788 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.87 
 
 
544 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.61 
 
 
848 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.61 
 
 
846 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.61 
 
 
848 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.61 
 
 
848 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  22.48 
 
 
872 aa  100  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  21.77 
 
 
737 aa  100  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0282  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.2 
 
 
341 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  23.63 
 
 
872 aa  99  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  23.72 
 
 
872 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.72 
 
 
872 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  23.72 
 
 
872 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  23.16 
 
 
872 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  23.72 
 
 
872 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  23.16 
 
 
872 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  23.16 
 
 
872 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.45 
 
 
730 aa  97.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  21.61 
 
 
855 aa  96.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.28 
 
 
730 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
1140 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.66 
 
 
696 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  24.51 
 
 
848 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  24.48 
 
 
726 aa  95.1  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
1140 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  23.54 
 
 
699 aa  94.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  21.69 
 
 
899 aa  94  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
1140 aa  94  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  25.28 
 
 
1455 aa  93.6  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  21.33 
 
 
899 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  22.05 
 
 
872 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  25.1 
 
 
778 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.53 
 
 
846 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  24.27 
 
 
845 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.27 
 
 
845 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  24.6 
 
 
845 aa  90.5  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  24.6 
 
 
845 aa  90.5  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  23.15 
 
 
739 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  21.66 
 
 
845 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.06 
 
 
586 aa  90.1  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.33 
 
 
845 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  24.77 
 
 
729 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.64 
 
 
702 aa  84.3  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  22.69 
 
 
768 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 
579 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
591 aa  81.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.12 
 
 
851 aa  81.6  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.8 
 
 
811 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  24.94 
 
 
650 aa  80.5  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.15 
 
 
743 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  22.54 
 
 
740 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 
620 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.65 
 
 
794 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.48 
 
 
804 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  23.63 
 
 
734 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  23.72 
 
 
664 aa  77.4  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.97 
 
 
822 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.93 
 
 
831 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.45 
 
 
734 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.97 
 
 
834 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.33 
 
 
810 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 
659 aa  73.9  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.67 
 
 
930 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  22.41 
 
 
672 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  24.46 
 
 
749 aa  71.6  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  21.59 
 
 
718 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>