229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0406 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1116  cellulose synthase (UDP-forming)  56.11 
 
 		 691 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.772245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2615  Cellulose synthase (UDP-forming)  59.5 
 
 		 641 aa  728    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0406  cellulose synthase (UDP-forming)  100 
 
 		 658 aa  1343    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3768  cellulose synthase (UDP-forming)  56.51 
 
 		 677 aa  665    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.092957  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2832  cellulose synthase (UDP-forming)  60.19 
 
 		 669 aa  771    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0415  cellulose synthase (UDP-forming)  100 
 
 		 658 aa  1343    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3450  Cellulose synthase (UDP-forming)  61.13 
 
 		 659 aa  832    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0394  cellulose synthase (UDP-forming)  100 
 
 		 658 aa  1343    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193019  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1828  Cellulose synthase (UDP-forming)  53.82 
 
 		 656 aa  633  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0282  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  59.63 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0281  cellulose synthase (UDP-forming)  63.04 
 
 		 314 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  43.9 
 
 		 665 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  43.95 
 
 		 712 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  43.15 
 
 		 716 aa  201  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0321  putative glycosyl transferase  34.46 
 
 		 620 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  39.41 
 
 		 696 aa  178  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.99 
 
 		 702 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  39.45 
 
 		 699 aa  174  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  41.83 
 
 		 869 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0298  cellulose synthase (UDP-forming)  32.35 
 
 		 618 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.78317  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  35.29 
 
 		 872 aa  167  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  39.53 
 
 		 739 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  41.28 
 
 		 845 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  39.41 
 
 		 846 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  41.28 
 
 		 845 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  41.28 
 
 		 845 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  35.06 
 
 		 741 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  41.06 
 
 		 869 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  41.06 
 
 		 869 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  40.45 
 
 		 845 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  40.45 
 
 		 845 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.85 
 
 		 848 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.85 
 
 		 846 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  41.99 
 
 		 1455 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.14 
 
 		 845 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.85 
 
 		 848 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  40.85 
 
 		 848 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.85 
 
 		 848 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  40.85 
 
 		 846 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  33.24 
 
 		 872 aa  161  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  33.24 
 
 		 872 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.24 
 
 		 872 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  33.24 
 
 		 872 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  33.24 
 
 		 872 aa  161  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  37.88 
 
 		 867 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  33.24 
 
 		 872 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  33.24 
 
 		 872 aa  160  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  36.36 
 
 		 872 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  37.88 
 
 		 899 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  40.13 
 
 		 845 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  38.08 
 
 		 899 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  36.36 
 
 		 874 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  36.36 
 
 		 874 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  36.36 
 
 		 874 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  36.36 
 
 		 874 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  36.36 
 
 		 874 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  36.74 
 
 		 872 aa  157  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 		 857 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.89 
 
 		 851 aa  153  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  37.26 
 
 		 734 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.5 
 
 		 743 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  38.31 
 
 		 855 aa  151  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  38.43 
 
 		 1129 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.12 
 
 		 734 aa  150  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3128  cellulose synthase (UDP-forming)  33 
 
 		 607 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.887302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  36.53 
 
 		 737 aa  146  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  34.67 
 
 		 909 aa  145  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  37.5 
 
 		 726 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  35.64 
 
 		 778 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 		 1140 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  35.29 
 
 		 758 aa  139  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  35.27 
 
 		 788 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.46 
 
 		 822 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  35.27 
 
 		 788 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  41.97 
 
 		 1140 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.74 
 
 		 730 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  42.94 
 
 		 1140 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.74 
 
 		 730 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.94 
 
 		 834 aa  133  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  34.21 
 
 		 672 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.83 
 
 		 672 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  35.53 
 
 		 729 aa  133  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  33.82 
 
 		 788 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.81 
 
 		 831 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  31.69 
 
 		 666 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.59 
 
 		 664 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  33.46 
 
 		 672 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  34.54 
 
 		 544 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  39.7 
 
 		 811 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.66 
 
 		 930 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.52 
 
 		 768 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  32.03 
 
 		 664 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.32 
 
 		 804 aa  127  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.46 
 
 		 810 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.94 
 
 		 794 aa  127  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  32.22 
 
 		 661 aa  127  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  41.76 
 
 		 591 aa  126  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 658 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  34.21 
 
 		 659 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  35.16 
 
 		 652 aa  125  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>