281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01683 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  801    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  46.37 
 
 		 401 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  47.06 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  48.41 
 
 		 390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  47.33 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  48.26 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  47.2 
 
 		 414 aa  292  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  47.6 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  45.07 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  46.87 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  46.42 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  46.87 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  45.97 
 
 		 380 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  40.11 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  38.7 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  38.79 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  41.4 
 
 		 373 aa  232  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  38.52 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  39.52 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  39.32 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  36.89 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  38.46 
 
 		 394 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  28.76 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  27.2 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.93 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  33.17 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  22.22 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  25.67 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  28.37 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.61 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7133  monooxygenase, FAD-binding  29.23 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.61 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.18 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  25.75 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.37 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  34.18 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  24.88 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  33.16 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  22.42 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  26.29 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  25.42 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.45 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  22.42 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  25.58 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  26.91 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  28.88 
 
 		 496 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  30.32 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  25.2 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  26.6 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  24.57 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.89 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  26.03 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  26.7 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  24.07 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  22.22 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  30.22 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  21.72 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  21.13 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  30.21 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  24.65 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.76 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  31.22 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3295  monooxygenase FAD-binding protein  34.74 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  27.49 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  28.03 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.53 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  24.16 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  24.53 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25.23 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  28.49 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  23.86 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  26.67 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  26.17 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  26.67 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  24.02 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  28.04 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  27.74 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  28.17 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  28.17 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  24.27 
 
 		 364 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  31.35 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  23.78 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  25.98 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  25.13 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  26.84 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  24.26 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  26.79 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  23.72 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  26.45 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  26.65 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  24.93 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  22.22 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  26.26 
 
 		 424 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>