190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2789 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  100 
 
 		 200 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  81.68 
 
 		 188 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  74.01 
 
 		 169 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  51.98 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  67.32 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  55.06 
 
 		 178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  77.78 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60.47 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.54 
 
 		 157 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.03 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.62 
 
 		 173 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  46.59 
 
 		 162 aa  88.6  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.62 
 
 		 153 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.62 
 
 		 153 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.11 
 
 		 159 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.61 
 
 		 146 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  45.12 
 
 		 150 aa  85.5  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.86 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.61 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  48.48 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  36.84 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.38 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_004310  BR0883  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  38.52 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0874  sec-independent translocase  41.94 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.817267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.56 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2667  SEC-independent protein translocase protein  49.3 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.89 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1686  sec-independent translocase  47.89 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  51.56 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  39.52 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0588  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.39 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  49.3 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.77 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  40.23 
 
 		 104 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  34.29 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.64 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  46.77 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.46 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  36.36 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.08 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.25 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  48.28 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.47 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.98 
 
 		 128 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  37.66 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  35.59 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  31.52 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.52 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  31.52 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  31.52 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  31.52 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  33.7 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  43.9 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  33.7 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1144  twin-arginine translocation protein TatB  40.66 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  33.7 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  31.52 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  31.52 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  31.52 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  33.7 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  34.78 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  31.52 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  33.7 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  36.67 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  34.88 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  43.06 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  35.23 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.32 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  39.39 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  37.97 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.51 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.51 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  41.18 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  41.67 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  41.67 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0955  hypothetical protein  46.77 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  27.84 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  39.73 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  39.71 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  41.67 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.19 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.32 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.18 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  36.76 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  37.88 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.4 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  38.16 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  39.47 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  35.44 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  44.59 
 
 		 122 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.71 
 
 		 96 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  41.67 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 		 99 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.86 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.62 
 
 		 88 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>