51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4865 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  76.35 
 
 		 241 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  70.54 
 
 		 241 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  75 
 
 		 221 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  75.73 
 
 		 238 aa  325  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  71.43 
 
 		 241 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  75.5 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  49.12 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  47.03 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  47.5 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  44.5 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  43.04 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  45.88 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  46.11 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  44.33 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  47.03 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  41.55 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  43.96 
 
 		 302 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  45.03 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  46.96 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  44.69 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  39.25 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  41.52 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  37.75 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  40.12 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  35.59 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  35.38 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  36 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  37.22 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  39.08 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  35.8 
 
 		 177 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  35.06 
 
 		 198 aa  88.6  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  32.89 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  35.17 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  32.89 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  36.3 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  31.07 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  31.11 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  31.76 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  30.57 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  31.72 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  29.67 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2597  hypothetical protein  27.56 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  25.13 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  27.43 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  31.34 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 196 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  26.5 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  27.37 
 
 		 280 aa  42  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>