More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4200 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4200  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 328 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.795308  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0509  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 396 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4185  hypothetical protein  27.44 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21660  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00485243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0823  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0119  glycosyltransferase-like protein  24.87 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.165793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0350  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 417 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  21.78 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  32.94 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.61 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.51 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.9 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  30.37 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  28.09 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 381 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 428 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.38 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 850 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  30.89 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 1089 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  28.3 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4006  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0645  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.924062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  31.48 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  29.14 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  29.66 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 458 aa  62.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  29.78 
 
 		 859 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 1229 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 1241 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 860 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4565  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2071  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 1028 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0701  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 820 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  26.48 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  27.07 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>