More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0857 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0857  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  42.15 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  40.36 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  41.26 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  40.91 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  38.06 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  38.57 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  36.86 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  41.26 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  41.26 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  38.91 
 
 		 285 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  38.72 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  41.47 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  38.43 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  40.68 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  37.86 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  37.86 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.68 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  41.75 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  38.93 
 
 		 448 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  41.99 
 
 		 434 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  41.99 
 
 		 438 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  38.57 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  36.19 
 
 		 432 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  39.36 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  38.1 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  38.04 
 
 		 445 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  38.04 
 
 		 448 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  38.04 
 
 		 445 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  38.04 
 
 		 453 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  38.04 
 
 		 445 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  38.04 
 
 		 445 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  38.67 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 437 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  38.04 
 
 		 426 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  38.04 
 
 		 445 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  38.04 
 
 		 450 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  39.75 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  35.68 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  37.65 
 
 		 445 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  39.17 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  38.87 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  38.59 
 
 		 447 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  35.59 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  42.08 
 
 		 292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  39.66 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  37.65 
 
 		 445 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 		 353 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4838  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  41.55 
 
 		 368 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218023  normal  0.119301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  38.61 
 
 		 448 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  37.8 
 
 		 448 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.2 
 
 		 448 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  37.8 
 
 		 448 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  37.8 
 
 		 448 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  38.67 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.82 
 
 		 448 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  36.44 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  36.59 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  39.73 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 446 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 446 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 446 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 446 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 446 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  36.16 
 
 		 285 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  41.67 
 
 		 295 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 446 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 446 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.79 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  39.42 
 
 		 301 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  39.73 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5282  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  40.49 
 
 		 363 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105444  normal  0.215638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  38.91 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  39.73 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 446 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  37.15 
 
 		 433 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  37.95 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  37.75 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  36.1 
 
 		 432 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  36.1 
 
 		 432 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  36.18 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  36.18 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  36.18 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4748  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 		 354 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.644922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0123  ABC transporter-related protein  38.5 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>