More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0552 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0552  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
267 aa  540  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0483  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  81.72 
 
 
268 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7536  putative enoyl-CoA hydratase  78.73 
 
 
268 aa  394  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.99 
 
 
267 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0272  enoyl-CoA hydratase/isomerase  79.85 
 
 
268 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.342358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.94 
 
 
269 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  50.37 
 
 
260 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5361  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.72 
 
 
273 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00524739  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0442  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.51 
 
 
255 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475404  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.28 
 
 
267 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4536  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 
250 aa  191  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3862  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.29 
 
 
186 aa  181  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1056  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.25 
 
 
255 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
257 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
271 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
269 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  33.07 
 
 
663 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.85 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.45 
 
 
274 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
262 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.83 
 
 
651 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 
271 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 
260 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
269 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
259 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 
266 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.13 
 
 
257 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.08 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.59 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.11 
 
 
263 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
263 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2124  naphthoate synthase  34.83 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000363984  normal  0.0450036 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.95 
 
 
662 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.3 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
263 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
263 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
263 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
263 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 
259 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
260 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.92 
 
 
260 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.37 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  31.09 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.89 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
282 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 
263 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 
263 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
257 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.94 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 
263 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 
263 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 
263 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 
263 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 
263 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
264 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
264 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 
263 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 
263 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.96 
 
 
260 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
259 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 
261 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
262 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0720  2-ketocyclohexanecarboxyl-CoA hydrolase  33.33 
 
 
260 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>