More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3809 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  100 
 
 		 219 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  93.15 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  40.74 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5641  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  43.07 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  44.65 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  40.65 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0801  putative methyltransferase  44.19 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1590  methyltransferase  37.38 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 810 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.82 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  40.54 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  34.51 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  41.1 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  40.28 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  40.28 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  40.28 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  41.1 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  41.1 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  26.38 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  41.1 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  40.28 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1587  SAM-dependent methyltransferase  30.6 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  30.43 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  26.35 
 
 		 687 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  26.38 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  26.38 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  27.34 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  39.73 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  26.38 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.39 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  26.38 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  26.38 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  29.57 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 265 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 634 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  31.5 
 
 		 273 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 285 aa  52.4  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 299 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.78 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 365 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2675  hypothetical protein  30.49 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  32.23 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 311 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  29.57 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0764  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 301 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  29.81 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  32.35 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  32.35 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2185  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.38 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  38.14 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  32.35 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  32.35 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.32 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0585  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2762  methyltransferase  24.49 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1545  amine oxidase  29.05 
 
 		 732 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  26 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>