219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1866 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 99 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  89.9 
 
 		 99 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.61 
 
 		 99 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.58 
 
 		 99 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.08 
 
 		 99 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  50.52 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.23 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  42.67 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.19 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.67 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.67 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.67 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.63 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.67 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.83 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.33 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  37.5 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.46 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5255  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.02 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.083215  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.14 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.63 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  39.19 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  36.92 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  34.67 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.94 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.17 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.36 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1109  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0408  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0178675  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.99 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  34.18 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  29.41 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1880  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  28.95 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  27.27 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.47 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.08 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  35.14 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2319  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1513  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  28.24 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  29.07 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  29.07 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  29.58 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.65 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>