More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1472 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  100 
 
 		 292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  73.05 
 
 		 286 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  71.53 
 
 		 286 aa  428  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  70.89 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  50.83 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.41 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.02 
 
 		 283 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  47.55 
 
 		 282 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  51 
 
 		 274 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  48.61 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.42 
 
 		 279 aa  255  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.41 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  50 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  50.2 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  50 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 265 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  49.59 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  47.15 
 
 		 306 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.95 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50.43 
 
 		 254 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.19 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49.79 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50.43 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  46.62 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.97 
 
 		 304 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  49.16 
 
 		 259 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 267 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  48.4 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  48.51 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.97 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  47.48 
 
 		 261 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.32 
 
 		 259 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.29 
 
 		 254 aa  241  9e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  45.17 
 
 		 267 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.71 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  48.09 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  49.15 
 
 		 278 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  48.31 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.91 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.62 
 
 		 252 aa  239  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.88 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  47.84 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  47.84 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.56 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  42.97 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  49.4 
 
 		 262 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.9 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  48.21 
 
 		 262 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  46.8 
 
 		 275 aa  235  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.92 
 
 		 267 aa  235  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  45.28 
 
 		 284 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  48 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.48 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  44.14 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  48 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2790  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  47.21 
 
 		 267 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  43.08 
 
 		 258 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.25 
 
 		 261 aa  232  7.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 		 264 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  46.25 
 
 		 288 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  47.68 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0164  ABC transporter related  45.34 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  49.07 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45.67 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  48.23 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  48.07 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 260 aa  228  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.67 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  47.2 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  45.6 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.96 
 
 		 288 aa  227  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.49 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  45.76 
 
 		 245 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  42.23 
 
 		 271 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.12 
 
 		 256 aa  225  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  42.26 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.64 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2217  ABC transporter related  45.11 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.294499 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  48.44 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.11 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  44.88 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  46.37 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  45.6 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.01 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>