267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2012 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2012  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 188 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2315  dihydrofolate reductase  95.68 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2332  dihydrofolate reductase  67.02 
 
 		 193 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  34.24 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  36.87 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 		 169 aa  111  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  36.81 
 
 		 163 aa  111  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  34.44 
 
 		 172 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  34.44 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  35.2 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  38.24 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  34.97 
 
 		 167 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  36.52 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  38.2 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  34.46 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  35.59 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  35.96 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  35.56 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  35.56 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  39.86 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  35.39 
 
 		 163 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  34.64 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  34.83 
 
 		 164 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  36.52 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  34.07 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  35.96 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  33.89 
 
 		 164 aa  104  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  35.39 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  40.27 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  36.87 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  35.47 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  37.08 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  35.91 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  36.67 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  37.43 
 
 		 163 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  34.88 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  34.27 
 
 		 165 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  36.52 
 
 		 160 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  36.52 
 
 		 160 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  35.03 
 
 		 171 aa  101  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  36.46 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  36.87 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  35.56 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  32.96 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  36.31 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  33.51 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  35.96 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  34.83 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  35.37 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  35.96 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  33.16 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  33.52 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  35.71 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  35.59 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  33.15 
 
 		 166 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  34.81 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  32.97 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 		 160 aa  98.2  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  37.27 
 
 		 155 aa  97.8  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  36.99 
 
 		 161 aa  97.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  36.52 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  35.95 
 
 		 163 aa  97.8  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  33.52 
 
 		 160 aa  97.4  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  37.84 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  36.77 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  35.2 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  33.71 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  35.59 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  32 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  34.29 
 
 		 161 aa  95.9  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  32.8 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  33.89 
 
 		 169 aa  95.9  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  33.71 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  32.04 
 
 		 163 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  36.61 
 
 		 160 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  34.08 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  36.88 
 
 		 194 aa  95.1  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  37.33 
 
 		 160 aa  94.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  33.15 
 
 		 171 aa  94.4  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  34.48 
 
 		 161 aa  94.4  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  34.44 
 
 		 167 aa  94  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  33.52 
 
 		 160 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  33.15 
 
 		 167 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  31.28 
 
 		 160 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  36.91 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  35.16 
 
 		 167 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2167  dihydrofolate reductase region  35.16 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  35.57 
 
 		 171 aa  92.8  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  31.43 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  36.94 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  36.31 
 
 		 171 aa  92.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  33.89 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  33.7 
 
 		 163 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>