66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1675 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  736    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  82.63 
 
 		 353 aa  615  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  30.29 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  28.53 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  29.12 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  27.64 
 
 		 417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  26.82 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  28.48 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  29.29 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  26.52 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  28.78 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  28.15 
 
 		 317 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  28.65 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  27.51 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  30.26 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  26.09 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  27.96 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  28.61 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  28.07 
 
 		 361 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  27.07 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  28.36 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  28.25 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  28.27 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  28.36 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  28.36 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  28.07 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  28.07 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  27.14 
 
 		 354 aa  96.3  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  28.39 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  25.53 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  27.65 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  27.53 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  27.89 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  27.63 
 
 		 323 aa  93.2  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  26.16 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  27.41 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  24.93 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  24.78 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  24.78 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  25.74 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  25.96 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25.14 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  26.65 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  27.04 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  26.14 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  24.85 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  26.24 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  24.78 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  23.65 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  25.29 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  24.48 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  25.29 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  23.84 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  23.72 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  23.98 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  24.62 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  24.76 
 
 		 943 aa  70.1  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  23.3 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  23.3 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  24.64 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  24.92 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  26.33 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  21.5 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  19.8 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>