More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0720 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0720  response regulator receiver, fis type  100 
 
 		 312 aa  647    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.935409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1766  response regulator receiver domain-containing protein  91.67 
 
 		 311 aa  598  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2288  response regulator receiver domain-containing protein  48.52 
 
 		 322 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1427  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2273  putative two-component response regulator  31.61 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.438912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  34.1 
 
 		 303 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.62 
 
 		 1355 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1404  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 154 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  41.13 
 
 		 154 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.73 
 
 		 994 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  32.52 
 
 		 823 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.53 
 
 		 629 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1912  cyclic nucleotide-binding protein  43.86 
 
 		 590 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0713503  normal  0.243299 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  38.35 
 
 		 447 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  43.18 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 		 449 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2388  response regulator receiver protein  38.73 
 
 		 154 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.319662 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.68 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  40.98 
 
 		 151 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  42.24 
 
 		 434 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  39.13 
 
 		 484 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01019  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  41.23 
 
 		 549 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.159296  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06147  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  41.23 
 
 		 549 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015374  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.83 
 
 		 472 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.83 
 
 		 472 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  40.91 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  40.83 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 365 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  42.02 
 
 		 456 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  42.24 
 
 		 438 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 		 473 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 806 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  37.68 
 
 		 451 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.32 
 
 		 469 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.32 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 		 1172 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 456 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  40 
 
 		 481 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  40 
 
 		 481 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  40 
 
 		 481 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.41 
 
 		 479 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  40 
 
 		 481 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  40 
 
 		 481 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  40 
 
 		 481 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  43.44 
 
 		 270 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  38.79 
 
 		 475 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  38.79 
 
 		 475 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  38.79 
 
 		 475 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  38.79 
 
 		 518 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  38.79 
 
 		 475 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  38.79 
 
 		 475 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  41.18 
 
 		 557 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  39.84 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  38.97 
 
 		 557 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  37.93 
 
 		 475 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  37.31 
 
 		 1180 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.3 
 
 		 317 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  39.1 
 
 		 553 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 1465 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  37.31 
 
 		 1156 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  31.97 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  34.03 
 
 		 492 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  33.13 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1895  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 185 aa  99  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.706146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2012  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 484 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1161  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 496 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.175427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.39 
 
 		 515 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  37.29 
 
 		 476 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  38.66 
 
 		 746 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3109  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 493 aa  96.3  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  35.25 
 
 		 441 aa  95.9  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2367  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 		 538 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 495 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0534594  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2363  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 189 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2524  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 137 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2721  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 188 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1570  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 210 aa  93.6  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 187 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5144  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 150 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 		 444 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 439 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4102  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 475 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  33.33 
 
 		 965 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  27.78 
 
 		 1111 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3805  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 		 439 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3962  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 495 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1021  putative PAS/PAC sensor protein  29.34 
 
 		 564 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3375  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2012  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 485 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3241  response regulator  32.21 
 
 		 428 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  37.29 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3757  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 499 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2645  response regulator  37.93 
 
 		 447 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0366662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 543 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 1183 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.9 
 
 		 452 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>