More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0903 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
270 aa  550  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.048792  normal  0.959739 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  72.8 
 
 
265 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  72.03 
 
 
265 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  36.54 
 
 
261 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
271 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 
257 aa  168  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
263 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
271 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
264 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
257 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
265 aa  165  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
264 aa  165  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
266 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
273 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
263 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
265 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
259 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0427  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
263 aa  159  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.82 
 
 
263 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  40.54 
 
 
263 aa  158  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
261 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
262 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
265 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 
269 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
267 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
274 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
262 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
260 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
266 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 
273 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
273 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
259 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
280 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
264 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
263 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
262 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
266 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
263 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
262 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
260 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
264 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
267 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
264 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 
262 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
263 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
273 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
266 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
262 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
284 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.33 
 
 
662 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.3 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.84 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
272 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
266 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
257 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
264 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
256 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
260 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
278 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
259 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.7 
 
 
661 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
267 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  34.25 
 
 
283 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
264 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.08 
 
 
271 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
259 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
263 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
267 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
268 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
277 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
263 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
260 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 
266 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.43 
 
 
662 aa  142  7e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
267 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11165  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 
268 aa  141  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.192459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>