214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0590 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  100 
 
 		 465 aa  938    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 396 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 416 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.54 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 406 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.78 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.66 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  25.54 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  25.54 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  25.54 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  25.54 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  25.54 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  25.54 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  25.54 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  25.32 
 
 		 491 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  25.32 
 
 		 491 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  25.32 
 
 		 492 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  25.11 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  25.11 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  28 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  25.52 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  25.46 
 
 		 495 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  24.48 
 
 		 491 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  25.15 
 
 		 464 aa  99.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  24.77 
 
 		 495 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  25.05 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 482 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  24.49 
 
 		 426 aa  96.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  25.54 
 
 		 493 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  25.54 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  25.54 
 
 		 493 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  25.54 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 482 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  25.54 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.19 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  27.78 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  33.49 
 
 		 426 aa  94.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  25.64 
 
 		 437 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  25 
 
 		 411 aa  94  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 415 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 415 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  25.64 
 
 		 437 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  25.64 
 
 		 437 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  25.64 
 
 		 437 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  26.64 
 
 		 428 aa  93.6  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 412 aa  93.2  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  25 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  25 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  25 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  25.22 
 
 		 489 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 388 aa  90.5  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  25.65 
 
 		 409 aa  89.7  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  23.04 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  21.17 
 
 		 417 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  24.47 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4070  HNH endonuclease  25.05 
 
 		 509 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 641 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  23.21 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  22.82 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 473 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  23.68 
 
 		 489 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  23.33 
 
 		 433 aa  87.8  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 456 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 473 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 473 aa  87  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 473 aa  87  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 473 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 473 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 473 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  32.18 
 
 		 457 aa  86.3  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 459 aa  86.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  23.33 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  33.16 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  25.85 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.16 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.16 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  23.58 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  23.09 
 
 		 434 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  33.68 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33225  Acetyl-CoA transporter  27.16 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.568918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>