82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1199 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 289 aa  593  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  98.62 
 
 		 289 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  88.58 
 
 		 289 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  79.93 
 
 		 305 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  58.48 
 
 		 293 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  58.82 
 
 		 291 aa  342  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  56.4 
 
 		 293 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 285 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  40.29 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  39.93 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  38.33 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 353 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  37.06 
 
 		 353 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  37.94 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  36.97 
 
 		 357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  36.97 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  36.97 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  36.97 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  36.97 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  36.97 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  36.97 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  37.06 
 
 		 353 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  34.87 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  34.69 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  37.8 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  37.41 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  35.52 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  31.37 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  33.78 
 
 		 382 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  31.05 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  35.78 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  33.2 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  34.62 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  31.15 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  30.56 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  29.56 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  31.15 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  31.15 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  31.15 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  31.15 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  31.15 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  29.45 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  29.92 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  30.33 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  28.81 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  31.21 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  31.71 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  27.95 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  29.47 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  31.71 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  30.29 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  26.77 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  27 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  26.11 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  29.01 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.17 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  25.66 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  22.93 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  27.78 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  27.11 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  24.49 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  25.23 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0341  hypothetical protein  24.86 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  25.62 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  23.24 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  23.26 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  25.21 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  25.21 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  27.53 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.398485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  25.21 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0256  aldose 1-epimerase  23.9 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  27.57 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  22.89 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  22.89 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  28.03 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  26.4 
 
 		 311 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  28.03 
 
 		 280 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>